第4章串数组和广义表.pptVIP

北京林业大学信息学院 【案例实现】 对于每一个待检测的任务，假设病毒DNA序列的长度是m，因为病毒DNA序列是环状的，为了线性取到每个可行的长度为m的模式串，可将存储病毒DNA序列的字符串长度扩大为2m，将病毒DNA序列连续存储两次。 然后循环m次，依次取得每个长度为m的环状字符串，将此字符串作为模式串，将人的DNA序列作为主串，调用BF算法进行模式匹配。 只要匹配成功，即可中止循环，表明该人感染了对应的病毒；否则，循环m次结束循环时，可通过BF算法的返回值判断该人是否感染了对应的病毒。 北京林业大学信息学院 【算法步骤】 ① 从文件中读取待检测的任务数num。 ② 根据num个数依次检测每对病毒DNA和人的DNA是否匹配，循环num次，执行以下操作： 从文件中分别读取一对病毒DNA序列和人的DNA序列； 设置标志性变量flag，用来标识是否匹配成功，初始为0，表示未匹配； 病毒DNA序列的长度是m，将存储病毒DNA序列的字符串长度扩大为2m，将病毒DNA序列连续存储两次； 循环m次，重复执行以下操作： 依次取得每个长度为m的病毒DNA环状字符串； 将此字符串作为模式串，将人的DNA序列作为主串，调用BF算法进行模式匹配，将匹配结果返回赋值给flag； 若flag非0，表示匹配成功，中止循环，表明该人感染了对应的病毒。 退出循环时，判断flag的值，若flag非0，输出“YES”，否则，输出“NO”。 北京林业大学信息学院 1. 了解串的存储方法，理解串的两种模式匹配算法，重点掌握BF算法。 2. 明确数组和广义表这两种数据结构的特点，掌握数组地址计算方法，了解几种特殊矩阵的压缩存储方法。 3.掌握广义表的定义、性质及其GetHead和GetTail的操作。 小结 * * * * void get_next(SString T, int next[]) { i= 1; next[1] = 0; j = 0; while( iT[0]){ if(j==0 || T[i] == T[j]){ ++i; ++j; next[i] = j; } else j = next[j]; } } 北京林业大学信息学院 KMP算法的时间复杂度 设主串s的长度为n,模式串t长度为m,在KMP算法中求next数组的时间复杂度为O(m),在后面的匹配中因主串s的下标不减即不回溯,比较次数可记为n,所以KMP算法总的时间复杂度为O(n+m)。 北京林业大学信息学院 next函数的改进 j 1 2 3 4 5 模式 a a a a b next[j] 0 1 2 3 4 nextval[j] 0 0 0 0 4 a a a b a a a a b a a a a ① a a a ② a a ③ a a a a a b i = 5; j = 1 i=4 j=4 j=3 j=1 j=2 next[j] = k，而pj=pk，则 主串中si和pj不等时，不需再和pk进行比较，而直接和pnext[k]进行比较。 北京林业大学信息学院 j 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 模式串 a b c a a b b c a b c a a b d a b next[j] 0 1 1 1 2 2 3 1 1 2 3 4 5 6 7 1 2 0 nextval[j] 1 1 0 2 1 3 1 0 1 1 0 2 1 7 0 1 北京林业大学信息学院 void get_nextval(SString T, int nextval[]) { i= 1; nextval[1] = 0; j = 0; while( iT[0]){ if(j==0 || T[i] == T[j]){ ++i; ++j; if(T[i] != T[j]) nextval[i] = j; else nextval