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- 约 64页
- 2016-12-16 发布于辽宁
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新疆大学硕士毕业论文
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硕士研究生学位论文
新 疆 大 学
论文题目(中文):Kiyik河胡杨内生细菌多样性分析及一株潜在新种的多相分类学鉴定
论文题目(外文):Diversity of Endophytic Bacteria from the Populus euphratica in kiyik ancient river and taxonomic identification of a novel bacterium
研 究 生 姓 名:布阿依夏姆·阿木提
学 科 专 业:生 物 学
研 究 方 向:微生物学
导师 姓名 职称:艾尔肯·热合曼 教授
论文答辩日期 2013年5 月 24 日
学位授予日期 年 月 日
Magisterial Thesis
Diversity of Endophytic Bacteria from the Populus euphratica in kiyik ancient river and taxonomic identification of a novel bacterium
Master Degree Candidate: Buayshem Hamood
Mentor: Prof. Erkin Rahman
College of Life Science and Technology, Xinjiang University
摘 要
本研究对位于塔里木河中游废弃343年的古河道胡杨林胡杨茎秆液进行可培养内生细菌的多样性分析。三颗胡杨茎秆液混合之后采用常规培养法分离得到80株纯培养物。其中25株从LB培养基,21株从NB培养基,16株从KB培养基而18株从MA培养基所分离到的。有32株杆状,45株短杆状和3株球状,17株革兰氏阳性,63株革兰氏阴性细菌。表型特征和16S rRNA基因序列系统发育分析结果显示,80株菌归类为厚壁菌门(Firmicutes)、 HYPERLINK /wiki/%E6%94%BE%E7%B7%9A%E8%8F%8C%E9%96%80 \o 放線菌門 放线菌门(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)等5个类群,16个属,24个种。其中属于γ-变形菌的细菌为49株,占分离菌株的61.25%(49/80);属于厚壁菌门的细菌为15株,占分离菌株的18.75%(15/80);属于α-变形菌纲的细菌为10株,占分离菌株的12.5%(10/80);属于放线菌门的细菌为7株,占分离菌株的8.75%(7/80);属于拟杆菌门的细菌为1株,占分离菌株的 1.25%(1/80)。假单胞菌属(Pseudomonas)是占优势属,占分离菌株的43.75% (35/80)。
在80株细菌当中发现与Pseudomonas xinjiangensis、Pseudomonas sabulinigri、Pseudomonas azotifigens、Pseudomonas pelagia、Rhizobium rosettiformans、Microbacterium hydrocarbonoxydans、Microbacterium sedminis 、Halomonas sulfidaeris、Halomonas meridiana、Halomonas desiderata、Nesterenkonia aethiopica、Nesterenkonia suensis 、Nocardioides alkalitolerans、Planococcus maritimus、Pontibacter salisaro、Planomicrobium koreense和 Pantoea brenneri等模式菌株有着低于98.7%的16S RNA基因序列相似性的59株细菌。初步认为是14种潜在新分类单元,需对其进行进一步研究。
对潜在新种的详细多相分类学研究结果表明,菌株KBL-4-9是短杆状,无鞭毛,严格好氧,细胞内积累类脂粒(PHB,即poly-β-hydroxybutyric acid 聚-β-羟基丁酸)的革兰氏阴性菌株。生长温度是4-45℃(最适37℃),pH范围是6.0-9.0(最适pH 7.0),NaCl浓度范围是0-3%(w/v)(最适是0-1%)。 与Pseudomonas xinjiangensis S3-3T有97.24%的16S rRNA基因序列相似性和41.2%的DNA-DNA杂交率。基因组D
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