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细胞生物学第三次作业题目：肌动蛋白的结构和功能姓名：陈涛学号：1200012156院系：生命科学学院手机：188114636282014年12月肌动蛋白的介绍在大多数真核细胞中，肌动蛋白是最为丰富的蛋白质之一。它拥有高度保守的结构特征，同时参与蛋白质与蛋白质之间的相互作用。肌动蛋白在离子，大量肌动蛋白结合蛋白以及核苷酸水解的控制下，可以在单体和纤维状聚合体两种结构中进行转化。这些功能使得肌动蛋白在细胞正常功能的行使中参与了重要的作用，例如：细胞运动和维持细胞形态；细胞极性；转录的调控等等。此外，纤维状肌动蛋白和肌球蛋白之间的相互作用是肌肉收缩的基础。肌动蛋白单体的结构脊椎动物主要表达有三种不同的肌动蛋白亚型：骨骼、心脏、平滑肌的三种α亚型；在肌肉和非肌肉细胞中表达的β和γ亚型。三种亚型只有很少部分的氨基酸差别，其中绝大部分差别是在N端(1)。肌动蛋白也经历了多种不同形式的翻译后修饰，比如：骨骼肌α肌动蛋白的His73位点的甲基化。N端的甲硫氨酸和半胱氨酸残基被乙酰化和裂解，产生的N端天冬氨酸被再乙酰化。因为一开始对肌动蛋白的晶体结构的测定是肌动蛋白和DNase I的复合物(2)，超过80种结构被报道出来，如图一。图1肌动蛋白单体结构来自(Dominguez and Holmes 2011)(3)绝大多数这些结构是肌动蛋白结合蛋白（ABPs）与小分子的复合物，或者是通过化学修饰或者变异等方法阻止了聚合的肌动蛋白单体。但是如果忽略结合的分子和核苷酸分子，肌动蛋白单体的构型大致都是一致的。肌动蛋白和糖激酶、己糖激酶、Hsp70蛋白属于同一个结构总科。和该家族里的其他蛋白质相同，肌动蛋白的375个氨基酸形成的多肽链折叠成两个主要的结构域：α和β结构域（图1a）。鉴于它们在肌动蛋白纤维上的位置，这两个结构域也被作为外层结构域和内层结构域，又因为它们在电镜下显著的大小差别，它们被称为小结构域、大结构域。然而传统上又把其结构分为四个子域(2)：1和3子域结构相关，可能出现自基因复制，而2和4子域可看作1和3的大型插入子域。肌动蛋白的两个结构域之间没有太多的联系，多肽链只在两结构域之间经过两次：中心环的Lys336残基和链接螺旋Gln137-Ser145这个结构也是两个结构域的枢纽中心，从而形成了上下的两个裂口，上部裂口结合核苷酸并于二价阳离子相关联（细胞内Mg2+），在1、3子域间的下部裂口由很多疏水氨基酸残基相关联，这个裂口功能和肌动蛋白单体在纤维中的相互作用有关，也是大多数肌动蛋白结合蛋白的结合位点(4)。这两个裂口间的联系也表明了为何核苷酸与肌动蛋白纤维组成以及肌动蛋白结合蛋白的结合有关。肌动蛋白结合蛋白有DNase I、Gelsolin、Profilin、ADF/Cofilin、RPEL Domain还有其余的小分子。鉴于篇幅在此不多做叙述。肌动蛋白纤维的结构虽然肌动蛋白单体和纤维密切相关，但是肌动蛋白单体和纤维中的肌动蛋白亚单位结构是不一样的。因为没有办法结晶肌动蛋白纤维，所以肌动蛋白纤维的结构细节是从肌动蛋白纤维的凝胶x射线衍射以及电子显微镜的数据中推断出来的。现在已经产生出了肌动蛋白纤维的原子模型。肌动蛋白纤维的负染色电镜图显示肌动蛋白由两条链组成，两条链互相缠绕成右手螺旋(5)。实际的对称性是一个左手遗传螺旋，在轴向35.9nm也就是每6圈中大约有13分子重复。沿着螺旋方向分子的距离是27.6?。因为每个分子的扭曲为-166度大约180度，因而结构就像两个右手螺旋的组合，见图2。图2、肌动蛋白纤维结构来自(Dominguez and Holmes 2011)(3)关于肌动蛋白纤维模型的提出， Fujii et al.(6)和Oda et al.(7)均提出了自己的模型，他们的模型是相似的，最重要的差别是D-环。而Fujii et al.直接观测到了这个结构，并且他对结构做的调整更加细微，因而他的模型更可靠。图3、来自(Dominguez and Holmes 2011)(3)接触面的立体观见图3。分子间的强键沿着纤维的轴向，强键发生在双起点的长距螺旋的相邻分子之间。图3中的沿着遗传螺旋被编号为-2、-1、0、1、2。轴向的相互作用是广泛存在的。一个非常重要的相互作用是位于相邻分子的4和3子域之间：4子域的Pro243-Asp244-Gly245环与上一分子3子域的两个环有相互作用，它们是一个环中的Pro322 和 Met325残基和另一个环的Met283,Ile287, and Asp288残基。第二种纵向的交互作用涉及D环。0号亚单位的D环连接到2号亚单位的下部裂口（即1、3子域裂口），此外，Ile64残基与2亚单位的3号子域成键链接(6)。轴向的相互作用主要是静电的作用，也有输水相互作用的影响。肌动蛋白单体与肌动蛋白纤维