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第十一章 微生物的分类和鉴定 内 容 第一节 通用分类单元 一、种以上的系统分类单元 二、学名 三、几个概念 第二节 微生物在生物界的地位 一、生物的界级分类学说 二、三域学说及其发展 内 容 第三节 各大类微生物的分类系统纲要 一、Bergey氏原核生物分类系统纲要 二、Ainsworth等人的菌物分类系统纲要 第四节 微生物分类的鉴定的方法 一、经典分类鉴定方法 二、现代分类鉴定方法 几个数字 生物种数:150余万种 微生物种数:15万-20万(已记载的) 微生物分类学 Microbial Taxonomy 生物分类学 一门按生物的亲缘关系把它们分门别类的排成各种分类单元或分类群的科学。 分类学任务 分类:宏观的战略工作 鉴定:微观的战术行工作 命名:开拓性的创新工作 微生物分类学的发展 经典分类学 微生物系统学(Microbial Systematics) 微生物分类学 Microbial Taxonomy 分类(Classification):是指根据相似性或亲缘关系,将一个有机体放在一个单元中 命名(Nomenclature):是按照国际命名法规给予有机体一个科学的名称 鉴定(Identification):是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。 第一章 通用分类单元 分类的级别 一、种以上的系统分类单元 七级分类单元(Taxon,Taxa,Category) 界(Kingdom) 门(Phylum) 纲(Class) 目(Order) 科(Family) 属(Genus) 种(Species) 以啤酒酵母为例,它在分类学上的地位是: 真菌门Eumycophyta 子囊菌纲Ascomycetes 内孢霉目Endomycetales 内孢霉科E.domcetaceae 酵母属Saccharomyces 啤酒酵母S.Cerevisiae Hansen 种的概念 种:最基本的分类单位; 微生物种的定义的不明确性 种的性状(可交配标准、形态学) 分类的大起大落变化 微生物的遗传本质和分子进化 分类人的思想倾向、技术条件,研究条件的重要性 种的概念 种(Species) 基本分类单位,指一群在形态、生理方面彼此非常相似或性状差别微小的个体。或是一群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其它种有着明显差异的菌株的总称 菌株(Strain) 某条件、地区分离到具体菌株。它是由一独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代,典型菌株(TypeStrain),模式株(TypeSpecies) 实例:Bifidoboacterium bifidum ATCC 29521 微生物分类学的新手段 分子生物学 微生物基因组学:以基因组为基础进行分类 新种(Species nova,sp.nov或nov sp.) 指权威性的分类鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物 Corynebacterium pekinese sp.nov AS 1.299 北京棒杆菌AS 1.299新种 Corynebacterium crenatum sp.nov AS 1.542 钝齿棒杆菌的 AS 1.542新种 种的分类地位举例 二、微生物的学名 俗名(Common name,Vernacular name) 结核杆菌:结核分枝杆菌 红色面包霉:粗糙脉胞菌 学名(Scientific Name, Scientific nomenclature) 菌种的科学名称,是按照“国际命名法规”进命名并受国际学术界公认的通用正式名称,由拉丁词或拉丁化的词组成 林奈的“双名法” Binomial nomenclature 三名法
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