09-结构生物学-2-new概论.ppt

Δ = BC BC= acosΦ Δ = acosΦ acosΦ = h? cosΦ = h?/a Δ = acosΦ-acos?0 = h? cosΦ = cos?0 +h?/a a(cosΦ-cos?0) = h? a(cos?-cosa0) = h? b(cos?-cos?0) = k? c(cos?-cos?0) = l? Laue diffraction h,k,l are integers Bragg equation 2dsin? = n ? Miller 指数 hkl 若某平面点阵族中离原点最近的一个平面点阵在x, y, z 轴上的截距分别为 a/h, b/k, c/l， 则该平面点阵族的Miller 指数为 ( hkl )平面点阵族(hkl)中两相邻平面之间的距 离称为该平面点阵族的面间距 d ( hkl ) d ( nh nk nl ) = d ( hkl ) / n 倒易点阵 正点阵：a, b, c 倒易点阵：a*, b*, c* a · a* =1, a · b* =0, a · c* =0 b · a* =0, b · b* =1, b · c* =0 c · a* =0, c · b* =0, c · c* =1 方向：a*? b, cb*? a, cc*? a, b 大小：a*=bc Sin ?/Vb*=ac Sin ?/Vc*=ab Sin ? /V|s|=|s0|=1/? 2dsin? = n ? |CD|= 2/? sin ? n/d = 2/? sin ? d 1/d 晶格面 倒易点 O A B C 100 100 001 001 101 P Q RCrystal Diffraction 用大肠杆菌进行蛋白表达时，如果6xHis标签的蛋白在表达时形成包涵体，我们可以 尝试哪些方法去获得可溶的蛋白？ 在结构生物学的研究中，常用的真核表达系统有哪些，它们各自的优势是什么？ 现有一个蛋白X以GST-标签融合表达在大肠杆菌中，请设计一实验步骤来纯化此蛋 白X。该蛋白X有以下特性：分子量为10 kDa，PI为6.0 和该蛋白X只在pH从5.0到8.0 的 缓冲液中稳定。 4. 请简述NMR的基本原理及其在生物大分子结构解析上的优缺点。 简述蛋白质结晶的原理和常用技术。 简述对蛋白质晶体学的理解和未来展望。 简述如何从蛋白质数据库中寻找所需的目标蛋白质三维坐标，并显示其三维结构。 简述空间群 P 43212 所包含的信息。 简要说明HKL2000软件进行数据处理的原理（不要求具体步骤） 简述分子置换法和单波长反常散射法解析结构的原理 并比较两者的优缺点。 A4纸打印，左边装订， 封面写上课程名字， 姓名、学号、成绩（留空白） 答题前写上问题。 抄袭者得0分。 Exam 空间群 C 2 Crystal Lattice 单晶X-射线衍射理论 Crystal Diffraction X-ray tube X-ray spectrum with a copper anode 1.5418 X-ray tube with rotating anode Synchrotron radiation facility Shanghai synchrotron radiation facility Properties of synchrotron radiation Intensity Tunability Lifetime Crystal Diffraction Image plate CCD detector Crystal Diffraction X-ray transmission image ?=12397.639/E (eV) Characteristics of X-ray Absence of lenses for X-rays. Anomalous dispersion for macromolecular phasing Radiation damage Anatomy of an electromagnetic wave F = A+iB = |F|(cos?+isin?) = F(cos ?+isin?) exp(i?) = cos ? + isin? F = F exp(i?) F3 = F1+F2 = F1exp(i?1) + F2exp(i?2) Scattering of X-rays by a single atom Atomic scattering factor i1234 ai (e-)2.311.021.590.87 bi (?2)20.84410.2080.56951.651