第三节计算机辅助药物设计简介.pptVIP

简介 20世纪80年代初期计算机辅助分子造型术与合理药物设计相结合，发展成现总称为计算机辅助药物设计(CADD)的一大类方法. 计算机辅助药物设计是应用量子力学、分子动力学、构效关系等基础理论数据研究药物对酶、受体等的作用的药效模型，从而达到药物设计目的。?? ?? 计算机辅助药物设计的基本原理 首先通过X－单晶衍射等技术获得受体大分子结合部位的结构，并且采用分子模拟软件分析结合部位的结构性质，如静电场、疏水场、氢键作用位点分布等信息。然后再运用数据库搜寻或者全新药物分子设计技术，识别得到分子形状和理化性质与受体作用位点相匹配的分子，合成并测试这些分子的生物活性，经过几轮循环，即可以发现新的先导化合物。计算机辅助药物设计大致包括活性位点分析法、数据库搜寻、全新药物设计。 对接术（Docking）  分子对接法是基于受体的，即将小分子配体对接到受体的活性位点，并搜寻其合理的取向和构象，使得配体与受体的形状和相互作用的匹配最佳。在药物设计中，分子对接方法主要用来从化合物数据库中搜寻与受体生物大分子有较好亲和力的小分子，从而发现全新的先导化合物。 对接术的特点 分子对接由于从整体上考虑配体与受体的结合效果，所以能较好地避免其他方法中容易出现的局部作用较好，整体结合欠佳的情况。目前具代表性的分子对接软件主要有 DOCK。 对接术实例 研究人员以HIV蛋白酶为靶进