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一、名词解释:
转录: 是指以DNA为模板,在依赖于DNA的RNA聚和酶催化下,以4中NTP(ATP、CTP、GTP和UTP)为原料,合成RNA的过程。
转录单位 (transcription unit): 从启动子到终止子的序列 (转录起始点)。
模板链(template strand): 又称反义链, 指与转录物互补的DNA链(极性方向3’→5’)。
编码链: 又称有义链, 指不作模板的DNA单链(极性方向5’→3’)。
hnRNA:核内不均一RNA,是存在于真核细胞核中的不稳定,大小不均一的一组高分子RNA的总称。
转录的极性:转录的效率与转录单位的位置有关。
转录起始:RNA聚合酶与DNA转录启动子结合形成有功能的转录起始复合物的过程。
启动子(Promoters):指DNA分子上被RNA聚合酶、转录调节因子等识别并结合形成转录起始复合物的区域。
核心启动子:RNA聚合酶能够直接识别并结合的启动子。
RNA聚合酶:是催化以DNA为模板(template)、三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶。
C端结构域(CTD):RNApolⅡ的大亚基中有 C 末端结构域。CTD中含一保守氨基酸序列的多个重复Tyr-Serp-Pro-Thrp-Serp-Pro-Serp C端重复七肽。
沉默子(silencer):沉默子能够同反式因子结合从而阻断增强子及反式激活因子作用并最终抑制该基因的转录活性的真核基因中的一种特殊的序列。
增强子(enhancer):是一类正调控元件,能够从转录起始位点的上游或下游数千个碱基处来激活转录。
绝缘子(insulater):阻断增强子或沉默子的DNA序列。
上游:转录起点上游的序列,是调控区,与转录的方向相反。
下游:转录起点下游的区域,是编码区,与转录的方向一致。
转录起点:+1位点,RNA聚合酶的转录起始位点,起始NTP多为ATP或GTP。
转录泡:在转录时RNA聚合酶Ⅱ(RNAPⅡ)与DNA模板结合,会形成一个泡状结构,成为转录泡。
转录压制:指转录因子的过度表达,抑制受特异性调节基因的基本转录装置,引起转录抑制。
上游激活序列(UAS):TATA框上游的保守序列称为上游启动子元件或上游激活序列。
锌指结构:在蛋白质中,一小段保守的氨基酸序列(约23个氨基酸残基)结合一个锌离子而形成的一个相对独立的功能域。
终止子(terminator):在转录的过程中,提供转录终止信号的RNA序列。
抗终止子:有的蛋白因子能作用于终止序列,减弱或取消终止子的作用,称为抗终止作用,这种蛋白因子就称为抗终止因子。/引起抗终止作用的蛋白质。
RNA加工:指新合成的前体RNA分子所经历的结构和化学方面的修饰与成熟的过程。
帽子结构:在RNA链长度超过20-30nt之前,其5’端经化学修饰被加上了一个7-甲基鸟苷残基,这种5’末端的修饰称为帽子结构
poly(A)尾巴:核内不均一 RNA 和 mRNA 在其3’-末端的一个独特的结构,由 AMP 残基组成的长链。
多聚腺苷化(polyadenylation):添加 poly(A)到 RNA 分子上的过程。
SD 序列:原核生物起始密码子AUG上游7-12个核苷酸处一段可以与16SrRNA的3’端反向互补保守区。
选择性剪接:一个hnRNA(pre-mRNA)转录本,通过外显子的剪接、重组,产生多个成熟的mRNA的机制。
组成性剪接:一个基因的转录产物通过剪接只能产生一种成熟的mRNA.它和选择型剪接的区别是后者可以产生多种成熟mRNA。
剪接体:在剪接过程中形成的剪接复合物称为剪接体,剪接体的主要组成是蛋白质和小分子的核RNA(snRNA)。复合物的沉降系数约为50~60S,它是在剪接过程的各个阶段随着snRNA的加入而形成的。
RNA编辑:指由RNA水平的核苷酸改变所引起的密码子发生变化的一种预定修饰,一种RNA编辑是以另一RNA为模板来修饰mRNA前体。
内含子:断裂基因的非编码区,可被转录,但在mRNA加工过程中被剪切掉。
外显子:断裂基因中的编码序列,在剪接后仍保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。
断裂基因:真核生物结构基因,由若干个编码序列和非编码序列互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码序列再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质。
启动子的清理:当开放的启动子复合物足够稳定是,RNA聚合酶离开启动子,释放出σ亚基,核心酶空出启动子位点以进行下一次转录起始。
指导RNA:一类小RNA分子,其部分序列可与被编辑的RNA序列互补。
二、
● 3类特异性转录因子:酸性功能域、富含Gln功能域、富含Pro功能域
以3种方式发挥作用:①改变DNA构象
②影响基本转录起始复
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