生物信息数据处理上机实验指导.doc

《生物信息数据处理》上机实验指导 适用专业：生物技术与制药类 编写：解增言 生物信息学院 2015年3月 课程说明 一、课程名称：生物信息数据处理 二、总课时数：64 学时（理论48学时，实验16学时） 三、先修课程：计算机基础 四、课程教材： 理论部分：孟庆昌. Linux教程（第3版）. 北京：电子工业出版社，2011 实验部分：解增言. 生物信息数据处理上机实验指导. 2014 五、上机实验要求： 本课程的上机实验要求： （1）掌握Linux系统的基本操作和VI编辑器的使用； （2）了解Linux环境下Perl语言的编写，C语言的编写、编译及运行方法； （3）掌握Shell编程的基本语法； （4）掌握命令历史、环境变量、管道、重定向的概念及使用方法； （5）能较熟练地运用Linux命令和Shell脚本程序处理生物数据。 六、考核方式： 平时成绩（考勤、平时表现等）：50% 实验报告：50% 目录 实验1：Linux常用命令练习（1） 3 实验2：Linux常用命令练习（2） 11 实验3：vi编辑器练习 16 实验4：Shell程序设计基础（1） 22 实验5：Shell程序设计基础（2） 26 实验6：Shell程序设计基础（3） 29 实验7：Shell程序开发（1）：gff文件处理程序 37 实验