NCBI序列提交方法详解.docxVIP

NCBI序列提交方法NCBI提交序列有两大类方式，一个是批量提交一个是单个序列提交。下面说的就是单个序列提交方式，这是最新的提交方式，由于NCBI更新很快，也许过段时间又不一样了，主要是按钮位置可能会变。首先要注册一个自己的NCBI账号：点击此处注册然后登陆账号：在已登陆状态下点击Submit：点击图中标记处选择GengBank：点击GO：选择：Banklt：建议认真阅读填写要求等：点击Sign in to use Banklt点击New Sub,下面是你提交的记录，即使你提交过程中中断了，也可以Continue!以下是具体提交过程：一．.填写基本信息二．图中1是作者名字，可以添加作者名，First和Last Name，填了就可以，其他可以不填。图中2是填是否出版，有三个选项：未出版，正在出版，已经出版。需要注意的是，如果选则未出版，需要在Title中注明，否则无法提交。可以添加作者，然后Continue即可。三.这是选择是用生么测序方法后的的序列现在我们用的一次只能测一条序列的都是Sanger测序，下面的454等都代表仪器型号，是我们现在说的高通量测序，简单的书不同型号灵敏度不同。这是选择你测序是一个反应还是几个反应，就是你这条序列是一个测序结果就出来了，还是几个测序结果拼在一起得到的结果，一代测序一个反应最可信的测序范围是50-750bp,根据实际选择，然后继续。填写序列信息：1.选择什么时候公布你的序列信息，你可以选怎立刻，也可以选择在以后的某一时间，如果你选择了时间，那么即使你已经上传序列，有了序列号，在时间未到的时候你也是找不到的。2.选择你的序列是不是16SrRNA基因是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列,可能有一个专门的库，所以一般选择NO3.选择你的序列类型，1.我选了cDNA ,然后选择是什么类型：是线性，我们一般的都是线状的，还是环状一般想线粒体，叶绿体或者各种质粒都是现状的。4.然后填写你上传了多少个序列，黏贴序列，注意序列一定要是FASTA格式。你也可以选择上传文档，这个自己学。然后继续两次继续。五．填写你上传序列所属物种。然后即使继续。六．选择你要你的序列式原始序列，就是你自己测序的序列，还是为已有序列做注释。然后继续。七．序列信息填写你基因所属细胞器填写你对基因的注释，可以添加选项，根据自己实际情况添加。最下面可以添加你的PCR引物，然后继续，会让你检查，你检查后继续即可。八．信息补充填加序列信息，可以上传文件，也可以选项填写，建议用选项。选择你的信息，可以添加，然后继续在上图中选择添加选项，会让你填写模板是正链还是负链，如果是部分序列，是哪一端，产物是指你把序列通过BlastP比对后的到的序列号（qualifiers）和相似度(Value),然后Accept。跳转后然后继续。九．最后会让你最终检查你的信息和再次确认你有没有要求，如果没有问题，就Finish。我是随便找的序列，不能提交的所以没法显示提交后给你的基因ID。