蛋白质结构测定的方法要素
X射线衍射研究大分子的局限性 进行X射线衍射谱的分析,通常高纯度的材料是必须的,首先实验样品应该仔细结晶,去获得高品质的适合X射线衍射研究的晶体。即使可以得到合适的结晶,大分子体系结构的测定仍然比小分子要困难得多。这是因为数目众多的大分子体系结构中的原子结构确定很困难。 同时对仪器要求的复杂性及数据分析都需要消耗大量的计算时间。X射线衍射必须在分子固相中进行,由此获得的结构信息可能就会与分子体系在生物活性状态的情况有所不同。 近年来,科学家们努力地发展建立了结晶学软件,大大加快了蛋白质结构测定的步伐。以前需要几周甚至几个月才能完成的工作,现在有可能在几小时到几日内完成。 完 蛋白质空间结构国内外研究动态 在国际上,美国首先提出大规模测定蛋白质结 构的计划,现在已经进入第二期的产出阶段. 其他发 达国家(欧盟和日本)也相继启动自己的结构基因 组计划. 我国根据美国第一期的试验计划,发现X射线晶体学仍然是测定结构的主要手段,这与预期的结果相符. 过去和现在情况都是这样,蛋白质结构数据库中的80%的结构来自X射线衍射. 其他有重要贡献的手段有核磁共振和低温冷冻电镜( cryo2EM). 由于这三种方法的重要性,最近几年,它们都有很大的改进. 理论方法的进展也非常快,与实验的结合也越来 越紧密.
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