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[实验步骤4
脂代谢相关基因siRNA沉默的实验步骤
第一部分:siRNA转染条件的优化及靶点筛选。
写文章所需要的数据:
1. 三对siRNA序列;
2. 转染效率及图片;
3. 对mRNA的抑制率及图片(非常重要)
4. 对蛋白质的抑制率及图片(非常重要)
实验步骤:
1. 准备工作
(1)培养瓶、玻璃吸管和枪头消毒;分装培养液、青霉素-链霉素和胰酶的管子消毒及分装;PBS配置及消毒。
(2)培养液分装100ml/瓶,使用100ml玻璃瓶分装;青霉素-链霉素分装1ml/管,使用冻存管分装;胰酶分装1ml/管,使用冻存管分装。
(3)培养液的配置,每100ml细胞培养液(美国Hyclone)中加入10ml血清(成都哈里生物)和1ml青霉素(10000U/mL)-链霉素(10000ug/mL)(美国Hyclone)。
2. HepG2细胞复苏
(1)从液氮中取出冻存管,直接浸入37温中,并不时摇动其尽快融化。取出冻存管打开盖子,用吸管吸出细胞悬液,加到离心管并滴加10倍以上培养液,混匀00rpm离心5min。
(4)弃去上清液,加入培养液重悬细胞,接种培养瓶,次日更换培养液一次,继续培养。uM/L的储存液。
① 25nmol/L siRNA×1.5ul/孔:不含血清不含抗生素的DMEM培养液150ul置于消毒EP管中;加入转染试剂4.5ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;加入阴性对照siRNA储存液1.2ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;室温下放置20min形成转染复合物;加入750ul无血清的培养液,处理时每孔加入50ul即可。
② 25nmol/L siRNA×3.0ul/孔:不含血清不含抗生素的DMEM培养液150ul置于消毒EP管中;加入转染试剂9.0ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;加入阴性对照siRNA储存液1.2ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;室温下放置20min形成转染复合物;处理时每孔加入50ul即可。
③ 50nmol/L siRNA×1.5ul/孔:不含血清不含抗生素的DMEM培养液150ul置于消毒EP管中;加入转染试剂4.5ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;加入阴性对照siRNA储存液2.3ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;室温下放置20min形成转染复合物;处理时每孔加入50ul即可。
④ 50nmol/L siRNA×3.0ul/孔:不含血清不含抗生素的DMEM培养液150ul置于消毒EP管中;加入转染试剂9.0ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;加入阴性对照siRNA储存液2.3ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;室温下放置20min形成转染复合物;处理时每孔加入50ul即可。
⑤ 75nmol/L siRNA×1.5ul/孔:不含血清不含抗生素的DMEM培养液150ul置于消毒EP管中;加入转染试剂4.5ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;加入阴性对照siRNA储存液3.4ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;室温下放置20min形成转染复合物;处理时每孔加入50ul即可。
⑥ 75nmol/L siRNA×3.0ul/孔:不含血清不含抗生素的DMEM培养液150ul置于消毒EP管中;加入转染试剂9.0ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;加入阴性对照siRNA储存液3.4ul,移液枪反复轻轻吹打混匀;室温下放置20min形成转染复合物;处理时每孔加入50ul即可。
(4)阴性对照siRNA转染HepG2细胞。若细胞状态良好,可以进行转染实验,否则重新培养细胞。细胞密度长至60%-80%时,换液,将配制的各种处理液滴加到各个处理孔中。滴加完毕,前后轻轻移动培养板使处理液均匀分布。置于培养箱中处理6-24h,荧光显微镜下拍照计数。
(5)转染率的计算。在荧光显微镜下,每人、每孔随机选取1个视野,计数荧光细胞数和总细胞数,计算转染率(转染率=荧光细胞数/总细胞数×100%)。
4. siRNA有效靶点的筛选
(1)HepG2细胞六孔板培养。取6张六孔板,编号1-6号,1、3和5号用于mRNA的检测,2、4和6号用于蛋白质的检测。共7个处理【3对siRNA+阴性对照(Negative control, NC)+转染试剂对照(Mock transfection, MT,用于检测转染试剂是否影响靶基因的表达量)+空白对照(Blank control, BC,不做任何处理,用于检测HepG2细胞中靶基因的本底表达)】+阳性对照(Positive control, PC,用于验证实验操作的正确性)。每个处理设2次重复。将消化并稀释好的细胞均匀接种于六孔板中(2-6×105/孔),每孔接种2ml。细胞密度长至60%-80%时,进行转染。
(2)siRNA转染复合物的配制。按照转染率最高的siRNA浓度进行配制。
三对siRNA的配置方法:
阴性对照的配制方法:
转
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