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离心管专门放置，专供蛋白处理使用。不与其他实验混用，减少交叉污染。实验室空间洁净，减少灰尘污染。 生物质谱室 生命科学研究中心 1062室蛋白质组样品污染 污染来源 角蛋白：皮肤，毛发，衣服，灰尘 PEG：塑料试剂瓶，离心管，保鲜膜和PE塑料手套（PEG是塑料加工中的“润滑油”，国产离心管PEG残留可能较多） 表面活性剂：蛋白提取液，清洗玻璃试剂瓶的残留 （SDS，CHAPS，Triton，Tweens，ND-40） 影响范围 角蛋白：角蛋白质谱信号压制样品蛋白质谱信号，引起低丰度蛋白信号丢失。导致色谱柱污染和超载。 PEG和表面活性剂：抑制多肽电离，降低样品信号强度，驻留色谱柱，降低分离效率。 角蛋白和PEG：污染SDS胶和蛋白溶液 表面活性剂：污染蛋白溶液 蛋白质组样品污染的影响 角蛋白污染无法根除，可通过如下方法缓解 交叉污染：专用，分开储存的优质离心管 环境污染：洁净的实验室空间，减少灰尘和空气流动 接触污染：洁净的乳胶手套和实验服 表面活性剂和PEG：使用超滤管（10 kDa）去除 样品污染解决方法 样品污染问题 污染较少的SDS样品酶解后的TIC图 严重PEG污染的的SDS样品酶解后的TIC图 PEG污染信号 相对污染较少的SDS样品酶解后的质谱图 严重PEG污染的的SDS样品酶解后的质谱图 PEG污染信号 污染较少的SDS样品蛋白鉴定结果：目标蛋白得分远高于角蛋白污染 蛋白鉴定结果 角蛋白污染结果 严重角蛋白污染的SDS样品蛋白鉴定结果：角蛋白得分远高于目标蛋白 蛋白鉴定结果 角蛋白污染结果 BSA酶解液 进样量 fmol 得分 覆盖率% 1 2 4112 61 2 4 6098 71 3 6 8077 73 4 10 9946 81 5 10-2 12059 81 6 14 12663 81 7 20 17571 81 8 40 24250 87 9* 40 14375 88 2 fmol ，约0.1-0.2 ng 蛋白样品就能实现较可靠鉴定 不必一味追求大进样量 减小进样量也能控制和减少污染 液质联用在蛋白鉴定中的灵敏度 离心管专门放置，专供蛋白处理使用。不与其他实验混用，减少交叉污染。实验室空间洁净，减少灰尘污染。
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