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上海大学2013 ～2014学年冬季学期研究生课程考试 课程名称： 基因工程 课程编号： 99SA09005 论文题目: 参数敏感性与癌基因突变的关系 研究生姓名: 刘仕进 学 号: 论文评语: 成 绩: 任课教师: 文铁桥 评阅日期: 注：后接研究生小论文，格式参照公开发表论文的样式。 摘要 最近几年对于肿瘤发生的研究取得了突破性的进展。通过研究发现，致癌的突变大多集中在一些重要的生物功能性通路上，这表明肿瘤形成机制与这些监管网络的动态行为有着密切的联系。在此我们提出一个假设，在不同生物网络通路上的这些肿瘤突变与这个网络的参数敏感性相关。为了验证这个假设，我们选取细胞DNA受损后导致凋亡的细胞通路来进行研究。我们先建立一个生物网络来模拟细胞凋亡通路，然后将其转化成相应的动力学方程，再通过对方程的参数敏感性分析得到相应的结果与对应的癌症基因突变的范围进行比对。所得结果显示，那些对于分叉点有明显影响的参数与那些高频突变的癌基因相互对应。综上，在检测生物网络的功能性和致癌基因突变频率上，用这些分叉点的位置来明显优于用在基因表达水平的重要蛋白。同时，这也表明相较于单独研究基因或者蛋白，综合的应用系统生物的分析更加适用。 关键字：肿瘤 细胞凋亡通路 参数敏感性 分叉点 Abstract One of the major breakthroughs in oncogenesis research in recent years is the discovery that, in most patients, oncogenic mutations are concentrated in a few core biological functional pathways. This discovery indicates that oncogenic mechanisms are highly related to the dynamics of biologic regulatory networks, which govern the behaviour of functional pathways. Here, we propose that oncogenic mutations found in different biological functional pathways are closely related to parameter sensitivity of the corresponding networks. To test this hypothesis, we focus on the DNA damage-induced apoptotic pathway—the most important safeguard against oncogenesis. We first built the regulatory network that governs the apoptosis pathway, and then translated the network into dynamics equations. Using sensitivity analysis of the network parameters and comparing the results with cancer gene mutation spectra, we found that parameters that significantly affect the bifurcation point correspond to high-frequency oncogenic mutations. This result shows that the position of the bifurcation point is a better measure of the functionality of a biological network than gene expression levels of certain key proteins. It further