水稻产量性状基因进展范例.ppt

水稻产量性状基因研究进展 韩保林 2012.12.31 质量性状与数量性状 质量性状 数量性状 质量性状与数量性状 间断分布 连续分布 能明确分组 不能明确分组 单基因 多基因（1主+多微） 质量性状与数量性状 相对 什么是QTL? QTL=quantitative trait locus 中文：数量性状座位或者数量性状基因座 含义：指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。 重要性：作物中绝大多数重要农艺性状和产量性状都是数量性状. QTL定位：按图索骥 初步定位 X 亲本P1 亲本P2 统计分析 精细定位 初级作图群体 性状数据 标记数据 遗传图谱 拿出基因 极端定位法 原理：同混池法 适合：抗病、效应较大 极端个体挑选 已经克隆的水稻重要产量QTL 基因 控制性状 位置 时间 GS3 粒长、粒重 3 2006 OsPPKL1 (GL3) 粒长 3 2012 qSW5/GW5 粒宽、粒重 5 2008 GW2 粒宽、粒重 2 2007 GS5 粒宽、粒重 5 2011 OsSPL16(GW8) 粒宽、品质 8 2012 Gn1a 穗粒数 1 2005 Ghd7 穗粒数、株高、抽穗期 7 2008 DEP1 穗形、穗粒数、着粒密度 8 2007 IPA1 株型（分蘖少、抗倒伏、） 8 2010 GS3：粒长、粒重 初步定位：NIL/BC3F2(C7/MH63) 精细定位：NIL/BC3F2(F1/MH63) 杂交类型：籼稻X籼稻 GS3 含5个外显子，编码一个由232 个氨基酸组成的跨膜蛋白 .与小粒品种相比，大粒品种GS3 第2 外显子中编码第55 位半胱氨酸的密码子TGC 突变成终止密码子TGA，造成蛋白翻译提前终止(缺失了178 个氨基酸). GS3 在幼穗中表达，并随着穗子发育而减少，在其它组织如胚、茎端分生组织、叶和茎中有微弱表达，但在根冠中大量表达 . GS3：粒长、粒重 GW2：粒宽、粒重 初步定位：F2 (WY3/FAZ1) 精细定位：NIL/BC4F2(F1/FAZ1) 杂交类型：粳稻X籼稻 亲本差异(千粒重）： WY3=41.9 FAZ1=17.9 GW2含8 个外显子,编码一个环型E3 泛素连接酶，位于细胞质中,可能参与降解促进细胞分裂的蛋白, 从而调控水稻谷的大小。 FAZ1的GW2 编码425 氨基酸蛋白产物，而WY3由于第4外显子上一个碱基的缺失，引起GW2 等位基因在转录过程中提前终止了翻译，产物只保留有115 氨基酸。 GW2：粒宽、粒重 qSW5/GW5:粒宽 qSW5: 初步定位：F2 (Nipponbare/Kasalath) 精细定位：NIL/BC3F3(F2/Kasalath) GW5： 初步定位：CSSLs RIL(IR24/Asominori) 精细定位：NIL/BC4F2(CSSL28/Asominori) 杂交类型：粳稻X籼稻 GW5 编码一个144 氨基酸组成的核定位蛋白，该蛋白包含一个核定位信号和一个富精氨酸区域。 GW5 与多聚泛素有相互作用，通过泛素蛋白酶体途径调节粒宽和粒重。GW5 功能的缺失将不能将泛素转移到靶蛋白上，因而使得本应降解的底物不能被特异识别，进而激活颖花外壳细胞的分裂，从而增加颖花外壳的宽度，最终谷壳的宽度、粒重以及产量都得到了增加。 qSW5/GW5:粒宽 GS5：粒宽、粒重 初步定位：DH（ZS97/H94) 精细定位：NIL/BC3F2(DH/ZS97) 杂交类型：籼稻X籼稻 GS5 编码丝氨酸羧肽酶。GS5 能够上调细胞周期基因的表达，促进细胞分裂而增加细胞数目以及增加横向的生长正向调控籽粒的大小. GS5 影响籽粒大小是由于其启动子的变异造成的. GS5：粒宽、粒重 GW8（ OsSPL16 ）：粒宽、品质 初步定位：SSSLs (Basmati385/HJX74) 精细定位：NIL/HJX74 杂交类型：籼稻X籼稻 编码启动子结合蛋白，高表达GW8将会促进细胞分裂、种子灌浆，从而增加粒宽和产量。而Basmati中GW8的缺失则会形成细长种子，提高品质。 GW8影响籽粒大小和品质是由于其启动子区造成的10-bp碱基缺失造成。 OsSPL16优先在发育中的穗部表达，穗长达到7CM时表达最高。 而在根、颈、叶鞘、顶端分生组织培、幼穗表达较少 GW8：粒宽、品质 qGL3（ OsPPKL1 ）：粒长、粒重 初步定位： F2(N411/N643) 精细定位：NIL/BC2F3(N411/9311) 杂交类型：粳稻X籼稻 亲本差异（千粒重）： N411=72.13 N643=17.80 93-11=30.08 qGL3（ OsPPKL1 ）编码