醫用分子生物学讨论课基因组DNA提取琼脂糖凝胶电泳RNA提取.pptVIP

醫用分子生物学讨论课基因组DNA提取琼脂糖凝胶电泳RNA提取.ppt

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3 分析不同发育时期基因的表达状况 获得新基因 研究基因的拼接 分析相应的蛋白产物 人类细胞质RNA提取 即逆转录PCR,提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。 RT-PCR的原理、方法 RT-PCR原理 principle 3 RT-PCR的原理、方法 RT-PCR方法 method 3 提取总 RNA 合成 cDNA PCR 分子生物学讨论课汇报展示 第五小组 1 人类基因组DNA提取 2 限制性核酸内切酶切割的原理、方法 3 琼脂糖凝胶电泳结果分析(DNA) 4 琼脂糖凝胶电泳的应用(DNA) 5 人类细胞质RNA提取 6 RT-PCR的原理、方法 7 琼脂糖凝胶电泳结果分析(RNA) 8 琼脂糖凝胶电泳的应用(RNA) 目录 人类基因组DNA提取 限制性核酸内切酶切割的原理、方法 汇报人: 哺乳动物的一切有核细胞都可以用来制备DNA, 除特殊要求外,白细胞、肝或脾组织是最常用的 材料。原始材料较少或较难获得时(如羊水细 胞),还必须经过细胞培养来获得足够量的细 胞;有时为了简便易行起见,还可以无创伤地采 集材料,如用口腔上皮脱落细胞、发根细胞。产 前诊断所用的材料则为胎儿的羊水细胞或者绒毛 膜细胞 SDS是一种去污剂,破坏细胞膜的脂质 膜; 蛋白酶K是一种很强的蛋白水解酶,能消化各种蛋白质(包括糖蛋白和肽类)及脂类 和胺类物质,但糖蛋白的降解物常与DNA 一同沉淀下来,干扰酶的活性,消化后需 要用酚、氯仿抽提纯化; 人类基因组DNA提取 原理 principle 1 酚能变性蛋白质而且还能将变性的蛋白质溶解在 其中; (加入1/3体积的饱和NaCl溶液,也可较好地祛除细 胞降解物而纯化DNA,可以避免酚的污染。) 氯仿也是一种有效的蛋白变性剂,它还能促进两 相的分离; DNA上清溶液再经氯仿抽提后用乙醇沉淀,分离 纯化的DNA。 人类基因组DNA提取 原理 principle 1 人类基因组DNA提取 1 提取 方法 从全血中提取 1 2 从口腔上皮脱落细胞,发根细胞中提取 人类基因组DNA提取 1 操作方法(全血) 点细胞裂解与RNase/蛋白酶K 消化   1. 取100 μl抗凝全血置于1.5ml Eppendorf离心管中,再加入100 μl裂解液和20 μl RNaseA/蛋白酶K液,用移液器来回吹打混匀,室于55℃温浴35分钟,其间来回颠倒离心管几次,直至溶液呈水溶状。   2. 加入10μl 3M的NaAc(pH 4.8),随后加入1250 μl结合缓冲液,充分振荡混匀,12,000 rpm离心30秒。 人类基因组DNA提取 1 DNA与吸附柱的结合操作 3.用移液器Tip转移上清并加入到离心吸附柱(套好收集管)中,放置1分钟,12,000 rpm离心30秒,倒掉收集管中的废液。 注意:待转移上清约1300μl,离心吸附柱容量约650 μl,故需每次转移上清650 μl到离心吸附柱中,离心,倒掉收集管中的废液,重复实验操作步骤3。 人类基因组DNA提取 1 DNA的纯化操作 4. 再加入600 μl洗涤缓冲液(washing buffer)到离心吸附柱(套好收集管)中,12,000 rpm 离心30秒。 5.重复步骤4一次,12,000 rpm 离心3分钟以充分除去洗涤缓冲液。 6.小心取出离心吸附柱,弃收集管,将离心吸附柱套入一个干净的1.5ml Eppendorf 离心管,并加入50 μl洗脱缓冲液(elution buffer) 到离心吸附柱中(洗脱缓冲液一定要加在离心吸附柱的正中),放置1分钟,于12,000 rpm 离心30秒。 7.取出Eppendorf 离心管,其中便是所提取基因组NA。 无水乙醇沉淀时可见白色絮状物 0.8%琼脂糖凝聚电泳可见一基因组DNA条带 OD值测定 人类基因组DNA提取 实验结果 experimental result 1 饱和酚吸取时记得吸取下层的有机相 乙醇沉淀时,要沿离心管壁向DNA溶液中加入无水乙醇,轻轻摇动离心管混合至体系完全均一,见白色絮状DNA 收集细胞的多少是实验成功与否的关键 沉淀中加入1mlSTE后,打散细胞团便于充分消化细胞 人类基因组DNA提取 注意事项 matters needing attention 1 限制性核酸内切酶切割的原理、方法 1 定义 限制性核酸内切酶是可以识别特定的核苷酸序列,并在每条链中特定部位 的两个核苷酸之间的磷酸二酯键 进

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