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酶聯荧光RFLP技术标准
酶联荧光RFLP技术标准
1 全血或冻溶血抽提DNA
1.1 全血溶解
注:1)细胞溶解液(cell Lysis Buffer)pro-k)Protein Lysis Buffer)0.5ml血液样本而设定的,应精确保用各试剂用量。
①移取0.5ml全血,加入标记5ml管。
②加1.8ml细胞溶解液到各试验管,加盖,倒转数次使其混匀,置于冰盆内待到全部试验样本操作完备后,准备离心。
③在水平台式离心机上离心,1250rpm,离心时间5min,注意在离心前一定要配平。
④从离心机取出样本,仔细地倒去上清液,用新华滤纸吸取残剩上清液。注意,不要将离心沉淀物(pellet)2ml细胞溶解液,加盖,在旋涡混合器上,混匀沉淀团,重复第3-4步骤。
⑦再在旋涡混合器上,混匀样本。
⑧在第6步骤离心时,按下列配方准备蛋白酶混合液。
每个样本 ×10 ×20 ×30 ×40 ×50 ×60 Protein lysis Buffer 233.8μl 2.338ml 4.676ml 7.014ml 9.352ml 11.69ml 14.028ml Pro-k 3.7μl 37μl 74μl 11μl 140μl 185μl 222μl SDS 12.5μl 125μl 250μl 375μl 500μl 625μl 750μl Total 250μl 2500ml 5ml 7.5ml 10ml 12.5ml 15ml ⑨每样本管加蛋白酶混合液250μl,加盖,轻轻地倒转数次,禁止剧烈振荡。⑩将全部样本管放入恒温水浴摇床内,37±1℃培养2hrs,中速摇动。
⑾每管加50μl高氯酸钠(Sodium Porchlorate)1.2 DNA抽取
注:1)抽提溶液I,II,III都是剧毒试验,应带乳胶手套、口罩,在通风处操作。
2)用前,全部抽提溶液复温。
3)对于上述全部样本管按下列步骤进行操作。
①每样本管加等体积抽提溶液(约0.5ml),加盖扣紧,在室温倒转使之混合。
②将全部样本管配平后,放置在水平离心机内2000rpm,离心7min。
③Phenol相(淡黄色的有色相)在样本管液体的上层,吸弃Phenol相,继续进入第5步骤,假若Phenol相在样本管底部,液相(无色相)在上层,吸移上层液相和带有白色的界面层到新的管内,丢去Phenol相。
④每样本加等体积抽提溶液II(约65ml)加盖扣紧,在室温倒转使之混匀。
⑤离心2000rpm,离心时间7min,吸移上层相和界面到新管内。
⑥每管加等体积抽提溶液Ⅲ,加盖扣紧,倒转混合。
⑦离心2000rpm,时间7min,离心后小心从离心机内取出样本管,吸取上清部分,准备透析。
2 透析DNA
2.1 准备透析用具,试验器械、透析管、透析夹、透析液、容器、磁力搅拌机。
2.2 配制透析液1:100透析贮存液,配制2000ml。
2.3 准备透析管:将透析管剪成5cm长,一端用已标记透析夹封住,浸泡在透析液过夜备用。
2.4 将透析管从透析液中取出,用滤纸吸去残留透析液,吸移样本管上层相,放入透析管内,避免吸取界面,用透析夹封住另一端,放回透析液中,注意,认真验对透析夹与样本编号相对应,并记录。
2.5 样本透析在4℃冰箱中进行,磁力搅拌机搅动透析样本,每4h换一次透析液,共3次。
2.6 已经透析的大分子DNA在室温是稳定的,在4℃可以短期保存抽提DNA,若需要长期保存,应贮存在乙醇中,若者是在0.3M Ammonium Acetate。禁止冷冻大分子DNA。
3 DNA定量
3.1 制备0.8% Agarose凝胶
Agrose 1.2g
1×TAE Buffer 150ml
加到300ml三角烧瓶摇匀,放置微波炉中 2min,移出,用力水平摇匀,再放置微波炉 20秒,待冷至 65℃后,加 10μlEB·(mg/ml),将150μl溶解胶,倾入水平的制胶板框内,在一端插入17孔的梳子,在室温使凝胶固化45分钟备用,将已制好凝胶板浸入电泳槽缓冲液中,注入1×TAE缓冲液2000ml,缓冲液面有胶面上1cm为宜。
3.2 在65℃的干热器上,将DNA定量标准30NG、20ng、10ng、5ng、1ng和DNA可视性大小标准,放置在干热器上5min,离心。
3.3 吸取样管DNA 2μl(吸前注意将样本混匀)与8μl×loading Buffer在微量反应板上混匀,备用。
3.4 加样,依次从右向左加DNA定量标准和样本:
3.5 电泳条件:输出端电压90V(或经过混胶两端电压调至50V),万用表检测其直流电压,电泳时间1hr,关闭电源。在电泳时,需要观察电压,电流,以确保电泳在进行,简便的方法是观察两侧电极是否有电解气泡连续上
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