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《如何跟踪领域最新进展
如何跟踪领域最新进展今天写一些自己看文献的体会。做research最重要的素质之一,就是文献检索和阅读能力。即使是大牛人,也必须经常关注最近发表的文章,注意同行们的进展,以及自己不是特别熟但与自己研究相关的其它领域的进展等等,让自己的头脑保持常新。06年Nobel得主之一,UMass做MiRNA的那位(抱歉忘了该大牛名字了)就讲过,说他每天 think about starting a new project... (扯得有点远了)
我很喜欢阅读最新发表的文献,各个杂志各个方向的。而且我认为这些工作对我的研究很有帮助。然后我也发现周边的同学在这一块不是很熟,也不是很重视...(又扯远了。。。)
言归正传。今天先介绍用RSS跟踪最新发表的文献。各个期刊杂志会定期发表最新一期的文章,不同的杂志日期一般不一样。假如有好几十个杂志都有我感兴趣的内容,最笨的方法就是每天上各个杂志看看,是不是出了新的一期。其实大可不必这样。比如我们可以用RSS提供的自动订阅功能。一般的杂志网站上都提供这样的链接,不过可能不是很起眼,可以用find命令搜一下RSS。
假如你正在使用Foxmail的话,可以按照一下步骤订阅你所感兴趣的杂志:
1 打开Foxmail(我用的是6.5 beta 2,其它版本类似),单击红色框标示的区域,进入RSS管理区
2? 这是我这里的情况。 我订阅了20几个杂志,每个杂志出新的一期,或者是提前出版的文章,这里都会接收到,比如今天Bioinformatics杂志新出了5篇文章,双击右侧每一行标题,就会打开浏览器,显示Bioinformatics网站上的这篇文章。
3 我这里已经建立了两个所谓的“频道组Channel group”:blog和journals,如果你还没开始用的话,最初是一堆默认的频道组,像新闻什么的,都被我删掉了。在这个区域右键可以建立频道组和新的频道。比如你要订阅NATURE,你需要该杂志的RSS链接。登录其主页 /nature/index.html, 你可以在底部找到一个下图蓝色标示的链接,打开之后你会发现很多杂志列表,单击 Nature - issue 你就可以获得订阅NATURE最新一期的RSS地址了: /nature/current_issue/rss/ 。当然你也可以选择其它你感兴趣的杂志。
4 回到Foxmail,在频道组上右键单击,弹出菜单上选择建立一个新的频道,弹出一个对话框
5 直接 next,在新对话框内输入RSS地址,再next
6 接下来比较简单就不叙述了。如果跳出下面的警告,需要把上面第五步中的选项取消掉。
过些天讲其它的方式,包括 email alert, 以及 PubMed 和 ISI 提供的一些服务。如何跟踪领域最新进展上一篇文章 如何跟踪领域最新进展 介绍了用RSS订阅期刊最新内容的方法。这是比较泛泛的文献阅读,能比较全面地了解一个大领域的最新进展。此外还有另外一种情形,针对具体的研究课题。比如我现在在做基于网络的疾病基因预测,如何跟踪国际上在这一个问题上的最新进展呢?下面介绍的是我自己总结出的两种方法,我觉得比较有效,欢迎大家提更好的方法 ?
这两种方法的目的都是希望有一个程序或网站能帮我们定期搜索这一课题方向发表的最新文章,并以email的形式通知我们。问题是这个程序或网站如何知道我们需要的是哪些文献?下面的这两个方法在这一点上不一样,也比较有互补性。
方法1 关键词搜索
这个方法比较容易想到。实际上是将定期人工搜索的工作让机器自动来做。很多文献数据库都有这个服务,比如PubMed和ISI。这里推荐PubMed,因为文献更新比ISI快很多。根据我的经验,PubMed和杂志自己的网站更新速度差不多,比如AJHG提前出版的文章,PubMed立马就可以检索到,而ISI则需要等到文章正式出版,甚至再推后数月。下面是具体的操作。
PubMed saved search
1 首先想好搜索的关键词,能比较好的覆盖你所研究的课题,比如我用“disorder gene interactome”做关键词搜索,在结果网页上会有“save search”这一链接。
2? 单击这一链接,跳出一个对话框,问你是否需要email接收定期的检索结果。选择Yes单选项后可以看到更多的内容,可以选择搜索的频率,比如一周一次。注意:前提是你已经注册了NCBI的帐号,并且已经登录。否则请先注册并登录。
方法2 关键文章引用
关键词的方法可能仍然有些宽泛。另外一种更有针对性的方法是瞄准几篇关键文章,跟踪这些文章被引用的情况。一般我们做一个问题都有一些经典的文章,后人做这个问题在背景介绍里面几乎都要引用这些文章,那么我们只
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