基础强化报告新编范本-2013[精选].docVIP

学 号： 课 程 设 计 （基础强化训练） 题 目 DNA 基因排序 学 院 计算机科学与技术学院 专 业 班 级 姓 名 指导教师 2013 年 7 月 12 日 课程设计任务书 学生姓名： 专业班级： 指导教师： 工作单位： 计算机学院 题 目: DNA 基因排序 初始条件： 输入： 第一行包含两个整数：一个正整数n（0n=50）给出了串的长度，另一个正整数m（0m=100）给出串的个数。接下来就是m行，每一行包含一个长度为n的字符串。 输出： 输出是输入串的列表，按有序性从高往低排序。因为两个串可以相等，则按照它们原来的顺序输出。 要求完成的主要任务: （包括课程设计工作量及其技术要求，以及说明书撰写等具体要求） 1、完成算法分析； 2、给出对应的程序流程图； 3、给出能正确实现的程序源码； 5、给出试算截屏图； 6、课程设计工作的分析与总结； 7、给出不少于5篇参考文献。 时间安排：2013-7-8到2013-7-12 消化资料、系统调查、形式描述 1天 系统分析、总体设计、实施计划 3天 撰写课程设计报告书 1天 指导教师签名： 2013年 7 月 8日 系主任（或责任教师）签名： 2013年 7 月 8日 目录 1 注册资料 4 2 选题描述 4 3 算法分析 5 3.1 计算字符串的逆序数 5 3.2 计数排序 6 4 程序流程图 8 5 程序源码 9 6 试算截屏图 11 7 分析与总结 12 8 参考文献 12 DNA 基因排序 1 注册资料 用户名：yeling 密码：123456 选题题号：1007 2 选题描述 衡量一个序列的无序性的一种量度是：考虑每一个元素，得到无序对的个数。例如，在字母序列“DAABEC”中，这一量度值为5，因为D比它右边的四个字母都要大，并且E比它右边的一个字母要大。这一量度值称为序列的逆序数。序列“AACEDGG”仅有1个逆序对(E和D)—它几乎已经排好序了—但是序列“ZWQM”的逆序数为6（它根本就是无序的—确切地说应该正好逆序）。 你要做的事情就是对含DNA串的序列进行排序（这个序列只包含A、C、G、T四个字母）。然而，你需要对它们进行排序，不是按字母表的顺序，而是按有序性排序，按有序性从高往低排序。所有串的长度相同。 输入： 第一行包含两个整数：一个正整数n（0n=50）给出了串的长度，另一个正整数m（0m=100）给出串的个数。接下来就是m行，每一行包含一个长度为n的字符串。 输出： 输出是输入串的列表，按有序性从高往低排序。因为两个串可以相等，则按照它们原来的顺序输出。 样例输入： 10 6 AACATGAAGG TTTTGGCCAA TTTGGCCAAA GATCAGATTT CCCGGGGGGA ATCGATGCAT 样例输出： CCCGGGGGGA AACATGAAGG GATCAGATTT ATCGATGCAT TTTTGGCCAA TTTGGCCAAA 3 算法分析 3.1 计算字符串的逆序数 本题中，由于字符串中字符的范围是确定的，只有A、C、G、T，所以可以在O(n)内求出逆序数方法是：count作为记录逆序数的大小，初始化为0。从后向前插入字符，以下四个参数分别代表如果在左边加上A、C、G、T，逆序数会加上多少，left_A、 left_C、 left_G 、left_T。首先四个参数都初始化为0，然后从后向前插入字符，如果插入的是A：以后在前面插入C、G、T，逆序数都会增加，所以：left_C++；left_G++；left_T++;如果插入的是C：逆序数加上left_C,以后在前面插入G、T，逆序数都会增加，所以：left_G++；left_T++；如果插入的是G：逆序数加上left_G；以后在前面插入T，逆序数都会增加，所以：left_T++；如果插入的是T：逆序数加上left_T,以后在前面插入字符，逆序数都不会增加。因此有代码： for(i=length-1;i=0;i--) {//str是要计算逆序数的字符串，count为逆序数 a=str[i]; switch(a) { case A: left_C++; left_G++; lef