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MS的一些問题归拢
1、问:用MS构造晶体时要先确立空间群,可是那些空间群的代码是啥意思啊,看不懂,我想做的是聚乙烯醇的晶体,嘿嘿,也不知道去哪
可以查到它的空间群
答:A、要做晶体,首先要查询晶体数据,然后利用晶体数据再建立模型。晶体数据来源主要是文献,或者一些数据库,比如CCDC。
你都不知道这个晶体是怎么样的,怎么指定空间群呢?要反过来做事情哦:)
B、我不知道你指示的代码是数字代码还是字母代码,数字代码它对应了字母的代码,而字母的代码它含盖了一些群论的知识(晶系,对
称操作等),如果要具体了解你的物质或者材料属于那一个群,你可以查阅一下相关的手册,当然你要了解一些基本的群论知识.MS自带
了一些材料的晶体结构,你可以查询一下.
2、问:各位高手,我用ms中的castep进行运算。无论cpu是几个核心,它只有一个核心在工作。这个怎么解决呢?
答:请先确认以下几个问题:
1,在什么系统下装,是否装了并行版本。
2,计算时设置参数的地方是否选择了并行。
3,程序运算时,并不是时时刻刻都要用到多个CPU
3、问:我已经成功地安装了MS3.1的Linux版本,
串行的DMol3可以成功运行。
但是运行并行的时候出错。
机器是双Xeon5320(四核)服务器,rsh和rlogin均开启,RHEL4.6系统。
其中hosts.equiv的内容如下:
localhost
ibm-console
machines.LINUX的内容如下:
localhost:8
现在运行RunDMol3.sh时,脚本停在
? ?? ?$MS_INSTALL_ROOT/MPICH/bin/mpirun $nolocal -np $nproc $MS_INSTALL_ROOT/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe $rootname
$DMOL3_DATA
这一处,没法执行这一命令
并行运算时,出现以下PIxxxx(x为数字)输出
ibm-console 0 /home/www/MSI/MS3.1/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe
localhost 3 /home/www/MSI/MS3.1/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe
请问这是什么原因?谢谢!
答:主要是rsh中到ibm-console的没有设置
把/etc/hosts改为
? ?? ?? ?? ?? ?localhost.localdomain localhost ibm-console
在后面加个ibm-console
也希望对大家有帮助!
4、问:在最后结果的dos图中,会显示不同电子spd的贡献,我想问的是,
假设MS考虑的原子Mg的电子组态为2p6 3s2,那么最后的dos结果中的s,p是不是就是2p,跟3s的贡献.比如更高能量的3p是否可能出现在
dos中?
如果可能的话,在这种情况下,如何区分2p和3p的贡献,谢谢.
答:A、取决于你的餍势
势里面没有3p电子,DOS怎么会有呢?
自然,你的1p1s也不会出现在你的DOS中。
B、我觉得原子没有d轨道但是计算出来的DOS图上有d轨道的贡献,这可能是电子跃迁所引起的,虽然按照教科书上的d轨道上没有电
子,但是不排除有电子跃迁过去,但及时跃迁也应该只是很少的而且一般也都是这样。
C、我考虑的是dos并非指电子出现的几率,而是能级的密度.3p构成导带能级不可能吗?
没有d电子出现d的贡献可以理解是跃迁过去,那是不是也不否认3p的可能?
既然不可能有3p,怎么会有1s1p?毕竟一开始计算中已经做了近似?
D、第一性原理计算高于费米面的能带本来就不怎么可靠的。
现在,计算的带隙小于实验值,很大的原因就来源于价带计算不准。
p能量高于s不太好理解
这里有成键反键的因素
p的反键是有可能小于s的成键的
另外有时候原子电子组态没有d电子的时候计算结果也出现了d轨道
估计是做轨道投影的问题。vasp就有这个问题,但是可以消除这个错误的。
5、问:那位高手能够介绍一下MS中CASTEP的势能模型的适用范围?
比如说LDA的(PWC,VWN),GGA的(PW91,BP,PBE,BLYP,BOP,VWN-BP,PRBE,HCTH),能够简述一下其大致差别更好
答:LDA局域密度近似(LDA):局域密度近似(LDA)是第一阶梯。它仅仅采用空间点r处的电子密度n(r)来决定那点交换-相关能
密度的形式。交换-相关能密度由密度相同的均匀电子气完全确定。泛函的交换部分就准确的用均匀电子气的微分表达。各种不同的
局域密度近似(LDA)仅仅是相关部分表示方法不同,所有现代应用的局域密度泛函都基于Ceperly和Alder`s在80年代对均匀电子
气总能量的Monte Carlo模拟。
广义梯度近似(GGA):GGA是J
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