真核基因表达调控讲义..doc

真核基因转录调控（讲课内容， 缺图） 张俊武 一．基因表达概述 基因表达就是储存遗传信息的基因通过转录及翻译等步骤产生具有一定生物功能的蛋白质的整个过程。典型的细菌基因组包括约4,000个蛋白质基因，人基因组包括约10万个蛋白质基因，但在某一时刻仅有一部分基因表达。例如大肠杆菌中通常有5％的基因处于高水平转录活性状态。一些基因产物需要以很大的数量存在于细胞中来行使其功能，例如蛋白质生物合成的延伸因子在细胞内含量极其丰富。有些基因产物在细胞内的含量则很少，如修复DNA损伤的有关酶在一个细胞中可能仅含几个分子。对于同一基因产物的需要也可能随时间而改变，例如细菌中一些代谢途径所需的酶可随食物源泉的变化或消耗而增减。在多细胞真核生物发育过程中，一些影响细胞分化的蛋白质仅在一部分细胞中存在短暂时间。一些具有特殊功能细胞的特异化可能极大地影响了对某种基因产物的需要，最典型的例子就是在红细胞中的血红蛋白具有极高的浓度。总之在细胞代谢调节、细胞分化以及个体发育过程中，基因表达调节都是一个非常重要的组成部分。 (housekeeping genes)。例如，许多催化中心代谢途径(如柠檬酸循环)各步骤的酶的基因、肌动蛋白(actin)基因都是管家基因。恒定的、似乎不被调节的基因表达被称作基本的基因表达(constitutive gene expression)。实际上，基本的基因表达也是在一定的机制控制下进行的。 (inducible)基因。可诱导基因在特定条件下增强表达的过程叫诱导(induction)。例如，许多编码DNA修复酶的基因，在应答高水平的DNA损伤时被诱导。相反，在应答分子信号时表达产物减少的基因称为可阻遏(repressible)基因。可阻遏基因在特定条件下表达水平降低的过程叫阻遏(repression)。例如，当培养基中存在丰富的色氨酸时会导致细菌中催化合成色氨酸的有关酶基因表达的抑制。 RNA的降解、多肽链合成、多肽链的修饰及加工，蛋白质降解。在真核生物中，RNA从细胞核向胞浆的转运过程也是调节细胞内蛋白质浓度的重要环节。其中转录调节是研究的最清楚也是最重要的调节环节。 （一）原核生物基因表达调控的总体特点 1.表达调节相对比较简单。 2. 细菌中仅存在一种RNA聚合酶。这种聚合酶以全酶（核心酶＋起始因子）形式识别基因启动子的特殊顺序（主要是以-10和-35为中心的两个通用顺序），与启动子结合而起始转录。这种结合并不必须其它因子的协助。 3.许多基因是以操纵子为基础进行调节的。在细菌中，许多基因按照功能的相关性成群串联在一起，组成转录单位，受同一启动子驱动转录成多顺反子mRNA。这种由若干结构基因及共同的启动子以及行使控制功能的附加DNA顺序（如操纵基因）一起构成的基因表达的协同单位称为操纵子(operon)。许多基因的表达调节是以操纵子为单位进行调节的。 4.包括正性和负性两种类型的调节。 5.原核生物基因表达调节的明显目的主要是使单一的细胞适应营养环境变化以便细胞的生长和分裂尽可能最佳化。 (二) 真核生物基因表达调控的总体特点 真核生物细胞的RNA聚合酶有三种，分别催化18S和28S rRNA前体、mRNA、5S rRNA和tRNA的转录。RNA聚合酶必须在转录因子帮助下才能催化转录起始。 虽然存在正性及负性两种类型的调节，但以正性调节为主。 转录的活化与转录区的染色质结构变化有关。 发生在细胞核的转录与发生在胞浆的翻译之间的有形分离。 真核生物基因表达调节最终要达到的目的似乎是为了实现能作为胚胎发育及组织分化基础的一个遗传程序的调节。 三．调节基因转录的顺式作用DNA元件 DNA与蛋白质以及蛋白质与蛋白质之间的相互作用来实现。这里的DNA主要指调节基因转录的顺式作用元件(cis acting elements),蛋白质主要指反式作用因子(trans-acting factors)和辅助因子（cofactors） DNA顺序，如启动子（promoter）、增强子（enhancer）、沉默子（silincer）、隔离子（insulator）、基因座控制区（locus control region, LCR）等。， 1.启动子（promoter） DNA顺序。在原核生物，转录装置的主要成分是RNA聚合酶全酶（核心酶＋起始因子σ）。在真核生物，转录装置的主要成分除RNA聚合酶外，还包含一般转录因子。 RNA聚合酶II的核心启动子（core promoters）由四个不同的元件结合组成。RBE:TFIIB recognition element; TATA(TATA Box); In