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(Java调用R方法
JAVA 调用 R 语言简介R是统计计算的强大工具,而JAVA是做应用系统的主流语言,两者天然具有整合的需要。关于整合,一方面,R中可以创建JAVA对象调用JAVA方法,另一方面,JAVA中可以转换R的数据类型调用R的函数,互相取长补短。现在也有一个项目JGR,用JAVA做R的图形界面,可以实现高亮显示自动补全等,还能让JAVA和R互相调用。关于R中调用JAVA,我想主要是为了利用其面向对象的特性,毕竟R语言近来很致力于向面向对象发展,有个很好的项目rJava可以实现,在/rJava上。R中调JAVA对我似乎意义不大,本文主要介绍JAVA中调用R。 JAVA很适合开发应用系统,但是数学建模和计算能力非其所长,如果该系统需要进行大量的统计或者优化的计算,调用R是一种很好的方式。JAVA负责系统的构建,R用来做运算引擎,从而实现应用型和分析性相结合的系统。目前网上有两种方式使用java调用R。Rserve的方式介绍首先要介绍的是Rserve的方式,这是一个基于TCP/IP的服务器,通过二进制协议传输数据,可以提供远程连接,使得客户端语言能够调用R。目前Rserve作为一个package发布在CRAN上,可以直接使用install.packages(Rserve)进行安装。需要使用时在R控制台下加载该包,然后输入命令Rserve(),开启服务器,就可以供客户端调用。其客户端可以有多种,这里只介绍JAVA客户端。最早的客户端包是JRclient,在/Rserve上还可以下载到,但是现在该项目全部移到了/Rserve,使用REngine作客户端(和JRI一致),在该网站下可以下载到REngine.jar和RserveEngine.jar两个文件。如果用eclipse开发的话,在工程属性中导入这两个外部的jar包,就可以正常使用了。首先建立一个新的连接,然后就可以使用eval之类的方法将R中的表达式传到服务器端,通过R求值后传回JAVA中REXP类型的变量,然后打印出来,整个过程非常简单。由于不需要对R进行初始化,因此速度会比较快。在其他系统下可以同时建立多个连接,但是在Windows下只允许同时打开一个连接,后续的连接都会共有相同的命名空间。官网上不建议在Windows下使用Rserve,因为会丧失很多性能,他们推荐可以考虑DCOM的方式。不过DCOM那个工程没有现成的jar包可用,其实如果是拿R做分析系统中的运算引擎,单连接够用了。操作步骤在R里下载“Rserve”包,并安装安装好后,运行如下命令启动“Rserver” library(Rserve) Rserve()Starting Rserve... D:\PROGRA~1\R\R-30~1.1\library\Rserve\libs\i386\Rserve.exe 建立java工程,导入必要的包,写出测试用例目录结构如下(标红色的是需要的):Test.java 内容package com.rTest;import org.rosuda.REngine.REXP;import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;publicclass Test {publicstaticvoid main(String[] args) {try {RConnection c = new RConnection();REXP x = c.eval(R.version.string);System.out.println(x.asString());} catch (Exception e) { e.printStackTrace();}}}运行即可可能出现的错误Connection refused: connectorg.rosuda.REngine.Rserve.RserveException: Cannot connect: Connection refused: connectat org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection.init(RConnection.java:88)at org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection.init(RConnection.java:60)at org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection.init(RConnection.java:44)at com.rTest.Test.main(Test.java:9)这是由于“Rserve”服务器没有启动起来的原因,试试在R内运行如下语句 library(Rserve) Rserve()JRI的方式介绍另一种方式是JRI,全名是Java/R Interface,这
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