计算机在化学中的应用例析.pptVIP

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计算机在化学中的应用心得 这学期通过学习计算机在化学中的应用,在初步接触高分子化学的同时与当前快速发展、必不可少的计算机领域相结合,从而对高分子化学、数据分析以及公式编辑等化学软件方面有了更深的认识,同时也掌握了一种新的学习方法,使得在今后的学习、工作、生活中运用起来更方便。 ChemSKetch 通过对ChemSketch的学习,其简单却强大的绘图和分析功能如绘制复杂的化学结构式、准确绘制并分析同分异构体等,使我们对很多课本上见到的复杂的结构式有了更进一步的认识和掌握,一定程度上提高了学习兴趣,使得自我学习变得更加简单。 对ChemSketch的了解 基本操作 程序的安装、卸载、启动和退出; 文件的打开、保存、加页和减页; 工具栏的基本了解和应用。 对ChemSketch的了解 结构式绘制原则 由里到外 先环后线 键后原子 最后其他 先结构 后样式 先样式 后整理 先结构 后文字 策略:加法、减法、替换法。 对ChemSketch的了解 主要内容 烃的绘制 环的绘制 各种键型的绘制 各种原子或基团的绘制 各种模板(电荷、自由基、特殊结构)的使用 原子、键、环等位置如何改变 曲线、轨道的绘制 实验装置图的绘制 结构式的分析及3D模型绘制 等等。。。 一般化学结构式的绘制 draw normal draw continuous draw chains 左侧原子、自由基等替换栏 右侧模板栏的使用 原子、化学键性质的修改 特殊基团的输入和展开 原子、原子键位置及结构方向等的改变 交叉化学键的绘制及前后位置改变 加减法综合使用绘制复杂的化学结构式 绘图模式下的应用 特殊图形 化学方程式的补充 文字输入 等等。。。 特殊结构的绘制 电荷及自由基的录入 原子的编号 结构芳香性的显示 Show Aromaticity 特殊的化学键:楔形键、配位键等 结构的整理 Clean 空间二维三维位置的改变和倾斜 化学反应箭头的绘制及反应条件的录入 曲线及特殊图形的绘制 draw模式下的圆、四边形等一般图形的绘制 节点工具栏的使用:控制线和节点的灵活使用 Shift 键在ChemSketch中的妙用 Shift键可选择在当前页面中分散的多个结构对象 Change Position+Shift改变原子的位置,不加shift基团反转 拖动键+Shift可画水平或垂直的化学键 环+Shift可把两个环铆接在一起 Draw模式下Shift+图形可画出正方形、圆角正方形、圆形等。 其他 实验装置图的绘制:模板绘制,注意阳口与阴口的结合 分子轨道的绘制:模板绘制,注意大小轨道的选用 化学结构与名称的相互转化 化学结构的各种性质及同分异构体的分析 3D结构的绘制及优化 自定义模板的使用 数据与其他绘图软件如ChemBioDraw的共享 使用Chemsketch 绘制化学方程式 基本化学结构的绘制 化学反应符号的绘制 排版整理 通过对公式编辑的学习,现在可以绘制许多美观的方程式,突破了之前只能依靠有限的符号写出不美观的式子,这在今后论文的编写中非常重要。 与ChemBioDraw的求同存异 ChemBioDraw特别之处 适于画键线式 支持右键弹出菜单 支持无限次撤销 可预测质谱化学位移 可预测化学性质 Pen的使用(与节点工具栏的比较) Chem3BioD绘制及计算3D结构性质 绘制复杂结构式的例子——丁溴东莨菪碱 先画主体一部分——立体结构 添加其他结构——Draw Chains 绘制其他整体部分——环状结构 化零为整 化学键替换 原子替换 结构补充与整理 ChemSketch ChemSketch类化学软件的熟练应用对以后的化学方程式的书写、毕业论文设计以及对论文的编辑如绘制结构式、定性绘制一些相应的曲线工作中必不可少。而且ChemSketch使得原本抽象的事物变得清晰直观,有助于对化学类专业知识的理解,这是最重要的。 MathType 修饰符号与顶线底线(可涵盖多个字符) 修饰符号只能单个添加,与字符相距较小 Inline和Display的公式位置不同 Right-numbered编辑带编号的公式 Math模式下字体倾斜,Text模式下字体正体 单击或光标键可恢复原样式 等号、减号需在Math模式下输入 键盘输入的括号不能自动调节大小 Format中各种对齐方式 使用公式编辑器的例子 小结 在学习计算机在化学中的应用这门课的同时,不仅从这门课程本身学到了有用的知识,也明白了科技的飞速发展对我们的学习生活提供了很多

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