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基因的表达与调控(下) ——真核基因表达调控的一般规律 真核基因表达调控 特征:在特定的时间和特定的细胞中激活特定的基因,从而实现“预定”、有序的、不可逆转的分化、发育过程,使生物的组织和器官保持正常功能。 1、影响真核基因表达调控的因素 核小体:a.无调控蛋白时,基因表达减少。b.修饰改变核小体,让DNA结合蛋白与DNA的结合易于进行。 重复序列和内含子。 DNA与蛋白质结合,构象的变化,调节序列的增多。 转录和翻译的间隔,RNA的合成与转运,RNA的剪接和加工。 2、真核基因表达的调节特点 (1)多层次 (2)无操纵子和衰减子 (3)个体发育复杂 (4)受环境影响较小 3、分两大类 1.瞬时调控或可逆调控: 相当于原核生物对环境的变化作出的反应,象某种底物或激素水平升降时,或细胞周期不同阶段酶活性的调节。 2.发育调控或不可逆调控: 调控发生的主要水平: 转录水平调控 转录后水平调控:RNA加工成熟过程的调控 翻译水平的调控 蛋白质加工水平的调控 一、真核生物的基因结构与表达活性 单顺反子 结合组蛋白和非组蛋白 重复序列和内含子 DNA片段重排和增加基因拷贝数 基因调节区的位置和大小 空间间隔 有剪接成熟的过程 1、基因家族 真核细胞中许多相关的基因常按功能成套组合,被称为基因家族(gene family) 家族成员可以成簇存在,或者分散在不同的染色体中(或两者都有)。 基因簇(Gene cluster) 少则可以是由重复产生的两个相邻相关基因所组成,多则可以是几百个相同基因串联排列而成。 基因簇通过重复和变异形成 多数重复都在基因第一个拷贝附近产生第二个拷贝。有时这些拷贝保持联系,进一步重复可以产生相关基因的一个基因簇。 突变可以在一个拷贝中积累而不会使自然选择向不利的方向进行。然后这个突变的拷贝可以进化形成一种新功能,也许和第一个拷贝在不同时期或地点表达,也许获得不同的活性。 (1)简单多基因家族 串连方式前后相连。E.coli中有七个拷贝,每个拷贝中tRNA基因的种类、数量和部位发生变化。 真核生物 前体为45S 100处被甲基化(2-OH) 需要snoRNAs的参与(核仁小RNA,研究热点,由内含子编码。反义snoRNA指导rRNA核糖甲基化。) snRNA snRNA(核小RNA):指任何一个限制在核内的小分子RNA,一些snRNA在涉及剪接过程,另一些涉及RNA 合成反应。 核内RNA (U1, U2, U4, U5, U6 )与核蛋白组成snRNPs 剪接装置中的snRNPs和大量的附加蛋白,常称为剪接因子 (2)复杂多基因家族 复杂多基因家族一般由几个相关基因家族构成,基因家族之间由间隔序列隔开,作为独立的转录单位。 (3)发育调控的多基因家族 血红蛋白基因基本结构 但在生物个体发育的不同阶段,却出现不同形式的α和β亚基。 哺乳动物血红蛋白类α-珠蛋白基因家族、类β-珠蛋白基因家族都是由功能基因和假基因形成的一个基因簇。 α:16chr β:11chr 人类中,ζ和α是两条α类似链,ε、γ、δ和β是β类似链。这些链在不同的发育阶段表达。 在基因家族中,基因的排列顺序是它们在发育阶段的表达顺序。 无功能基因是指没有编码蛋白质能力的基因,没有活性的原因很多,可能是由于在转录或翻译(或两种中都有)过程中有缺失。它们被称为假基因(Pseudogenes),用符号ψ表示。 在脊椎动物β-珠蛋白的基因簇中普遍存在基因和假基因,小鼠的基因簇有7 个基因:2个早期胚胎表达基因;1个晚期胚胎表达基因,2 个成体表达基因,剩下2 个为假基因。鸡和兔的β-珠蛋白基因簇有4 个成员。 当前的珠蛋白基因簇是从一个原祖珠蛋白基因进化而来的 植物的豆血红蛋白(Leghemoglobin)基因可代表此基因的原始结构 一些“原始”鱼类仅有珠蛋白链 非洲爪蟾 (X. laevis) 珠蛋白基因的结构是一个连锁的α - β对的内部重复 α 和β珠蛋白基因的分开一定是由于哺乳动物/鸟类祖先的基因发生转座的结果 基因的趋异 我们可以把一个编码区的核苷酸序列分为潜在的置换位点(Replacement sites) 和沉默位点(Silent sites)。 置换位点上的突变应该引起相应氨基酸的趋异 人β-珠蛋白基因置换位点的多样性使我们能够再现其进化历史,图中树状进化图解释了一系列珠蛋白基因逐渐分离过程。 假基因 假基因:它们具有与功能基因非常类似的序列,但这些序列不能翻译成有功能的蛋白质。 假基因与功能基因一样的结构:有相当于外显子和内含子的序列。 基因表达过程中的突变,会使这些基因失去活性。 突变几种形式
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