如何用MEGA5.0和Clustalx1.83构建进化树概念.pptVIP

用MEGA5.1和Clustalx1.83构建进化树 组员：汤宏赤 曾伟 董明右 构建进化树的意义 进化树：用来表示物种之间的进化关系，又称“系统树”、“系谱树”。根据各类生物间的亲缘关系的远近，把各类生物安置在有分枝的树状的图表上，简明地表示生物的进化历程和亲缘关系。 意义：研究从单细胞有机体到多细胞有机体的生物进化过程，而且可以粗略估计现存的各类种属生物的分歧时间。通过蛋白质的分子进化树分析，为从分子水平研究物种进化提供了新的手段，可以比较精确的确定某物种的进化地位。 构建进化树的基本步骤： 1、核酸序列的获取：数据库查询、测序 2、序列比对：BLAST、Clustal X、Clustal W2等。 3、进化树分析：MEGA、PAUP4.0 、Phylip 、NETWORK4.11 、SplitsTree4 、TCS1.8 等。 参考序列选择注意事项： 1、不选非培养(unclutured)微生物为参比； 2、不选未定分类地位的微生物，最相近的仅作参考；c，在保证同属的前提下，优先选择16S rDNA全长测序或全基因组测序的种；d，每个种属选择一个参考序列，如果自己的序列中同一属的较多，可适当选择两个参考序列。 3、 使用clustalx1.83进行序列比对 M