生物信息学复习资料..docVIP

一、名词解释(31个) 生物信息学二级数据库多序列比对系统发育分析物种进化和系统分类的一种方法，其常用类似分的来概括各种（类）生物之间亲缘关系，树状分支的图形称为系统发育树。直系同源 指的是不同物种之间的同源性，例如蛋白质的同源性，DNA序列的同源性。（来自百度） 旁系（并系）同源FASTA序列格式开放阅读框（ORF）来自百度）结构域空位罚分来自百度）表达序列标签中随机挑选的克隆进行测所获得的部分3’或5’端序列。（文献）Gene Ontology 协会HMM 隐马尔可夫模型一级数据库序列一致性序列相似性Blastn：是核酸序列到核酸库中的一种查询。库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一地核酸序列比对。（）Blastp：是蛋白序列到蛋白库中的一种查询。库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。（来自百度） Blastx：是核酸序列到蛋白库中的一种查询。先将核酸序列翻译成蛋白序列（一条核酸序列会被翻译成可能的六条蛋白），再对每一条作一对一的蛋白序列比对。（来自百度）Tblastn：是蛋白序列到核酸库中的一种查询。与BLASTX相反，它是将库中的核酸序列翻译成蛋白序列，再同所查序列作蛋白与蛋白的比对。（来自百度）Tblastx：是核酸序列到核酸库中的一种查询。此种查询将库中的核酸序列和所查的核酸序列都翻译成蛋白（每条核酸序列会产生6条可能