SNP芯片服务-昆明中云美生物技术有限公司.docVIP

人类基因组由30亿个核苷酸组成，它们携带着人类的遗传信息并决定人体的生理特征。人类基因组序列的0.1%—0.2%在人种、人群和个体之间存在DNA序列的差异，即单核苷酸多态性（SNP，single nucleotide polymorphism）。许多的这些单核苷酸多态性可引起不同的遗传性状，即遗传的多态性（polymorphism），如ABO血型位点标记，白细胞HLA位点标记和个体药物代谢差异等。了解这些DNA序列的差异和单核苷酸多态性以及这些差异所表现的意义将给疾病的预测、诊断、预后和预防带来革命性的变化。 2005年4月29日，Affymetrix Inc.总裁苏珊西格尔女士率领代表团出席Affymetrix生物芯片上海服务中心的开张和揭牌仪式，标志着SBC成为国内第一个通过Affymetrix认证的，有资质的技术服务商。SBC为客户提供稳定而优质的Affymetrix SNP分析检测服务，为客户提供芯片杂交、洗涤、扫描和数据分析等服务。同时，我们还利用SBC与南方基因中心的合资子公司南方基因科技有限公司引进的Illumina微珠基因分型分析系统为广大科研工作者提供SNP芯片技术服务。 ? Affymetrix颁发给SBC的SNP 6.0芯片服务认证资格 近年来，SBC利用平台优势，为广大客户完成了多个项目，其中包括运用Affymetrix SNP 6.0芯片完成对狼人综合症疾病的遗传基础研究、Illumina芯片对银屑病易感基因的筛选等（详情请见参考文献）。 ? Affymetrix SNP芯片服务? 芯片推荐：Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 芯片介绍：Affymetrix Genome-Wide Human SNP 6.0芯片产品的涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物：包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化（CNV，Copy Number Variation）的探针： 1）482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片；?? 2）424,000个SNP包括了源来于国际HapMap计划中的标签SNPs，X，Y染色体和线粒体上更具代表性的SNPs,以及来自于重组热点区域和500K芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP；?? 3）202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针，这些区域来源于多伦多基因组变异体数据库。该数据库中的每个3,182个非重叠片断区域分别平均用61个探针来检测；?? 4）744,000个探针平均分配到整个基因组上，用来发现未知的拷贝数变异区域。 ? 具体应用：除了SNP基因分型之外，还能进行CNV研究。从而能够进行Copy-neutral LOH/UPD检测，亲子鉴定，纯合性分析、血缘关系鉴定。 ? ? 芯片推荐：Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array?芯片介绍：这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似，既包含SNP探针，也包含CNV探针。一共涵盖623,124个SNP位点和916,269个CNV探针。 ? 2011即将推出：Affymetrix Rice 44K SNP Genotyping Array（敬请关注） ? ? Illumina SNP芯片服务?芯片推荐：Illumina Human1M-duo beadchip?芯片内容：Illumina Human 1M- duo芯片中包含了超过一百万个探针信息，可以在一张芯片上平行进行2个样本的检测。该款芯片门包含针对基因SNPs，标签SNPs，拷贝数变化（CNV）,及其他高价值的基因组区域设计探针，同时还增加了一些新的位点，如：增加了疾病相关的SNP位点，灵活的选择一些基因组编码区高密度的SNP 位点。? 1）基因SNPs：约 400,000个SNP 基因区域10kb 覆盖 99% of RefSeq 基因，约 25,000个非同义 SNPs。 2）标签Tag SNPs：根据HapMap挑选标签SNP，在r2 0.8 前提下，Caucasian (CEU)，Han Chinese/Japanese (CHB/JPT)和Yoruba (YRI)人种中基因组覆盖率分别为95%，94% 和85% 。提供了最高限度的基因组覆盖率，在基因组中平均间隔为 2.4 kb。? 3）CNV 区域：探针覆盖了CNV高发区域如片段复制区域，megasatellites，SNP沙漠，MHC区;覆盖Database of Genomic Variants(DGV)数据库中已报导的CNV区域;特有探针覆盖DGV数据库中尚未报导的CNV区域。? 4）ADME (Ab