用于细菌鉴定和分类的分子生物学方.pptVIP

结果的判定：一般认为核酸杂交同源性小于 20％为不同菌属，20％ ～60％ 为属内紧密相 关的种，60％ ～70％为同种内不同亚种，大 于70％为同一亚种。 16SrDNA在细菌分类鉴定的应用 16SrRNA基因结构图 第一，由于16 S rDNA具有高度保守性，且分子小、包含的信息量较少，对于亲缘关系较近的细菌，其分辨率不高。 第二，16 S rDNA序列分析只能在属的水平上区分细菌，而在水平分类这个环节上仍然需要借助其他手段加以辅助分析。 细菌核心基因（看家基因） 虽然说细菌的基因组的大小和基因段是千差万别，但是无论多么小，它们必须包含有所有的信息去允许细菌去执行多种必要的功能，给予细胞维持内部的代谢平衡的能力，复制和进化，这三种主要的活细胞的功能。细胞经常能够吸收代谢物但其不是功能蛋白，因此，它们必须去依赖它们自有的基因产物去执行不要的功能。 gyrB基因 gyrB基因是普遍存在于细菌内编码DNA促旋酶中B亚单位蛋白的基因，属于信息通路中与DNA复制、限制、修饰或修复有关的蛋白编码基因。在大多数细菌中，以单拷贝的形式存在细菌基因组的rnpA—rmpH—dnaA—dnaN—recF—gyrB—rnpA基因簇中。编码的是唯一一种能诱导DNA负超螺旋的拓扑异构酶一DNA促旋酶的B亚单位蛋白GyrB。 Kasai在对小单孢菌属(Micromonospora)15个有效描