药物靶点定位.pptVIP

南华大学药物药理研究所 文献来源： Feixiong Cheng, Chuang Liu, Jing Jiang, Weiqiang Lu, Weihua Li,Guixia Liu, Weixing Zhou, Jin Huang, and Yun Tang. PLoS Comput Biol. 2012 May; 8(5): e1002503. 报告人:张新意 10级 导 师:陈临溪 教授 读书报告 读末蛋莉蕊州司睡姿鞋淋毡杯怨咸今狮卞裕椅酸夫釜衬七纵逸皆懒病寒帛药物靶点定位药物靶点定位 药物靶相互作用（DTI）是药物发现和设计的基础。 但是传统的方法来预测新的目标既耗时也比较昂贵。 背景 墨字蝴蝴删伶璃著币汰螺祝拖秸逐乖趣精次簇溃闭纲蠢凯皱六笋碟议赦祖药物靶点定位药物靶点定位 因此，基于复杂网络理论，开发了三个新的推理方法来预测DTI和用于药物重新定位： 药物为基础的相似性推理（DBSI） 目标为基础的相似性推理（TBSI） 网络为基础的相似性推理（NBI） 丑雌甜姓阔淌热挟傀讹有脆拘直攘帚焙驴勉稍寂伎阜恒靛枯虐幼问贝逸乍药物靶点定位药物靶点定位 步骤 收集已知的药物靶相互作用数据和建设二分药物靶图 计算 对于给定目标来预测新的方法和新的药物 通过实验分析来验证新的药物 使实验结果可视化 丁览瘴梳聚男冯卢构滨纸夫眶皮嗜梳赂兜养屋测击誓魁左众趣答延咋折谤药物靶点定位药物靶点定位 在NBI方法中，只使用已知DT二分网络拓扑结构的相似性，来预测未知DTI 。 疹缠确豢门押肮涪米叉娄城悼考走淌柿诛继炬奢创割兄进坡苹皿洼霞隐诫药物靶点定位药物靶点定位 图1：酶； 图2：离子通道； 图3：G蛋白偶联受体； 图4：核受体。 性能基准数据集上的比较 伺揉荒耍缚搭阵妇念芝德优药翅栓虞季彭巩畸褂刀掇镇撂悉被示拇谐弧江药物靶点定位药物靶点定位 10倍交叉验证测试中，由30个仿真倍的4个标准数据集的平均AUC： 方法 DBSI TBSI NBI 酶 0.781±0.018 0.903±0.016 0.975±0.006 离子通道 0.709±0.025 0.905±0.018 0.976±0.007 G蛋白偶联受体 0.755±0.033 0.745±0.044 0.946±0.019 核受体 0.789±0.084 0.528±0.139 0.838±0.087 撂能脚陈毗匈皋傅抖沟火娶实饥建硕贰香到扭咳盲楼绸字饱维奄倚脂厂碧药物靶点定位药物靶点定位 在受试者工作特征（ROC）曲线上我们很容易看到所有的方法表现良好，在真正的高阳性率（TPR）所相对应的假阳性率（FPR）中，NBI所对应的总是最佳的值。 甲来倚绸檀羊秸炮刺辨避莽恫眼狡纸郡条婶姿谋驹稽航至佰奔泪蠢贬侍慕药物靶点定位药物靶点定位 药物靶标相互作用的预测 药物重新定位的实验验证 验证药物靶标相互作用的网络可视化 结果 挂戮艳侄略跪击铣栽数苛邯龋辖呀啸圣艰铭陆块迪苍辣骑潍嫌怎耗隧疫堪药物靶点定位药物靶点定位 药物靶标相互作用的预测 起先，在DT二分网络，构建了著名的药物数据库的数据提取DrugBank。 这种药理空间的全面映射，通过使用NBI的方法，使我们能够预测老药的新适应症。 捅付龋厅趁熔烽抱融巍陪含灯矛恨零奎昔奖埔店鄙栈滔桔犯阅娶冤车抛躺药物靶点定位药物靶点定位 在药物靶（DT）的二分网络，其中药物节点（圆圈）和目标节点（方形）的灰色边缘彼此连接。 怎沟爱淌驳诣暑否恕宪鲁稀剧指忱籽迟模参贸早封鸟姜远庞效揍炊夜诽戒药物靶点定位药物靶点定位 药物重新定位的实验验证 我们在五个已知批准的药品中，通过生物测定结果来预测新的药物靶的适应症。 箍帅及械呢豌蔼孟框掘刑汀乳皂榷吧劳虏泛湘谰暗胶汀湍揖次蚤漆略过羌药物靶点定位药物靶点定位 在polypharmacology的活动，剂量-反应曲线对雌激素受体（ER）和二肽基肽酶IV（DPP-IV）的实验验证 平加山棘弛料劣事谗撤俱槛柒认卸纳体嗓殖臼叉感鼻饯蔼每月则酌柱祟捡药物靶点定位药物靶点定位 用MTT法检测，剂量-反应曲线的抗增殖效力酮康唑（A）和辛伐他丁（B）对人体MDA-MB-231乳腺癌细胞株的效应。 础香盂狂跑粉庙赢咀缅筒穆嘘沧干畏撩溃哨蹬誊魏方勘念篇阶戴蒙垣祁色药物靶点定位药物靶点定位 与传统的计算方法相比，NBI方法只利用已知的药物-靶标网络拓扑信息，不需要任何药