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简单序列重复(ISSR)区域标记分析家蚕突变体蚕品种之间的遗传关系
Dhanikachalam Velu, Kangayam M. Ponnuvel*, Murugiah Muthulakshmi, RandhirK.Sinha,SyedM.H.Qadri印度,生物技术实验室,中央养蚕的种质资源中心,osur - 635109,Tamil Nadu,
2007年10月23日出版,修订于2008年1月7日, 录于2008年1月24日
简单序列重复(ISSR)标记被用来确定基因突变蚕品种(家蚕)之间的关系。这项研究15个ISSR引物简单序列重复(SSR)。总共产生20个突变体,有113标记,其中73.45%是多态的。在选择突变体遗传材料时,平均(1.7080±0.4567)等位基因,有效等位基因(1.5194±0.3950)和遗传多样性(Ht)(0.2901±0.0415)。使用未加权的两组产生的树状图与算术平均法(UPGMA)和统计分析方法,使用Nei’的遗传距离形成的一个主要组6组分离20个蚕。因此,用ISSR扩增来确定突变蚕品种间的遗传变异性是一种有价值的方法。蚕品种种质资源中心的维护。
关键词: 遗传多样性; 家蚕;ISSR
引言
家蚕是被驯化的昆虫,用于生产丝绸,在印度,养蚕是一个基本的农业产业,它不仅可以提供高质量的生丝,还可以提高农民的收入。中央养蚕的种质资源中心有432个蚕品种,其中有20 339二化的突变体73 种多化的蚕品种。这些蚕在产量和其他表型参数方面都表明其生物多样性。不同的蚕品种一般表现型也不一样,例如,卵的颜色、幼虫的外形、茧的形状和颜色等。然而,遗传同一性在不同品系之间的关系也有类似的特征 所以,形态特征无法准确确定品种的遗传身份。它必须用品种的分子特征来分析种质资源的遗传多样性,而分子标记在形态学和生化标记上有许多的优点,因为这些标记不受环境的影响,它是稳定的、独立的(Bernatsky and Tanksley, 1989; Gepts, 1993) 。用聚合酶链反应(PCR)标记技术已开发,如简单序列重复标记(SSR)(Tautz, 1989),随机扩增多态性DNA标记(RAPD)(Williams et al., 1990), 简单重复序列区间标记(ISSR)(Zietkiewicz et al., 1994), 和扩增片段长度多态性(AFLP)(Vos et al., 1995).限制性片段长度多态性(Botstein et al., 1980)。这些标记技术常被用来研究某些植物和动物种群动态的遗传多样性(Zeitkiewicz et al., 1994; Tsumura et al., 1996; Dayanadhan et al., 1997; Gabierelsen and Brochman,1998;Wolfe et al., 1998; Knox and Palmer,1999).如RFLP分子标记(Shi et al., 1995), RAPD (Yasukochi, 1998), AFLP (Tan et al., 2001) and SSR (Reddy et al., 1999a; Miao et al., 2005) 用RFLP和PCR为基础的技术来研究蚕品种的遗传关系并构建其分子连锁图谱(Xia et al.,1998; Reddy et al., 1999a, 1999b; Nagaraju et al., 2001; Lu et al., 2002; Li et al., 2005). 也取得了进展,确定RAPD标记分配nonsusceptability位点densonucleovirus(Abe et al., 2000; Li et al., 2001)和抗核型多角体病毒(NPV)位点(Yao et al., 2003)。同样,AFLP(Lu et al., 2004)和ISSR(Chatterjee and Mohandas, 2003)标记被用来确定的数量性状位点(QTL)如产量性状和产茧量简单重复序列(ISSR)标记系统已被广泛用于植物和动物的遗传分析(Zeitkiewicz et al., 1994; Reddy et al., 1999b;Bornet et al., 2002; Vijayan, 2004)。家蚕遗传变异分析采用ISSR标记法,(Li et al., 2007)。此外,ISSR扩增技术能够区分个体之间的变异(Zietkiewicz et al .,1994)和评估种质的遗传多样性(Wolfe et al., 1998),ISSR分子标记法是利用非编码位点分散在整个基因组中,产生大数量的片段,具有生产重复
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