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分子生物学第03章线粒体基因组教程
线粒体基因组 3.1 线粒体基因组的大小 表3-1 线粒体基因组大小 分离完整线粒体DNA的方法 线粒体DNA分子的形状 线粒体DNA分子的形状 主宰染色体模型 环状DNA重复序列间的重组 图3-4 玉米线粒体基因组的环状分子 图3-1 人线粒体DNA基因图谱 表3-2 已确定的植物 mtDNA 编码基因 表3-4 不同生物线粒体之间遗传密码的变化以及与核基因的差异 线粒体基因中的内含子 图3-6 遗传信息在3个基因组间的转移 * 3.1 线粒体基因组的大小 3.2 线粒体基因组的组织结构 3.3 线粒体基因组的组成 3.4 线粒体基因的一些特征 3.5 RNA编辑 3.6 植物细胞质雄性不育与线粒体的关系 3.7 遗传信息在基因组之间的流动 Mitochondrial genome 植物线粒体基因组不仅特别大,还表现出很大的差异性,如西瓜与甜瓜线粒体基因组的差异。而动物线粒体基因组则小得多,大小也比较接近。但植物mtDNA所包含的有功能的遗传信息量并不比动物mtDNA大多少,主要是因为植物mtDNA含有很多内含子及重复序列,基因间的间隔区也很大。mtDNA突变快。细胞培养的mtDNA与正常植物中的mtDNA有较大的不同。 285 蚕豆 84 酵母 184.400 地钱 366.924 拟南芥 400 绿豆 32.211 红藻(C. merole) 1500 黄瓜 13.794 土壤线虫 2600 甜瓜 16.019 果蝇 330 西瓜 16.260 海星 540 玉米(雄性不育系) 15.697 海胆(P. lividus) 570 玉米(育系) 16.775 鸡 327 菠菜 16.398 鲸 219 甘蓝 16.298 牛 221 油菜 16.295 鼠 430 小麦 16.569 人 mt DNA (kb) 生物种类 mt DNA (kb) 生物种类 为了避免分离提纯线粒体DNA时带来的人工损伤,将线粒体制品包埋到低熔点琼脂糖凝胶中,然后用去垢剂和蛋白酶K处理以释放DNA,这种方法叫胶块内提取法,DNA分子结构基本上是完整的。然后将胶块放在制备好的琼脂糖胶样品池中跑脉冲电泳。在这种电泳中,环状DNA分子的泳动与分子量比它高得多的线状DNA分子相似(100kb环状DNA分子与2200kb线状DNA分子相似)。 mtDNA既有环状分子,也有线状分子,在一种生物体内也可能两种形态的分子同时存在。 动物mtDNA大部分是环状分子,周长约5.0~5.8μm,这不仅用电镜可以观察到,而且用CsCl密度梯度离心可以分离到它们的超螺旋分子。然而最近用人的细胞株mtDNA的研究表明,有1%左右是线状的,50%是环状的,其余是一种连环多聚体。 从脉冲场凝胶电泳上mtDNA的行为看,大多数植物和真菌的mtDNA表现出是线状分子,但也有很多植物中有环状分子。在一些植物线粒体中,含有大小不等的许多环状分子。如在烟草培养细胞中,整个线粒体基因组以一个亚基因组环的群体存在,大环与小环、小环与小环之间有联系。 根据“主宰染色体模型”(master chromosome model),有些植物线粒体基因组可以用单个环状DNA分子来代表,这个分子包含了所有的遗传信息,故称之为“主宰染色体”。如果主宰染色体上由许多正向重复序列对的话,通过分离重组就会产生许多大小不等的环状分子。 同向重复 反向重复 nad 1, nad 2, nad 3, nad 4, nad 4L, nad 5, nad 6, nad 7, nad 9 cyt b cox 1, cox 2, cox 3 atp 1, atp 6, atp 9 至少4个基因 已知至少10个 NADH-脱氢酶 cyt b cyt c 氧化酶 ATP合酶 cyt c 生物发生 保守ORF 呼吸链复合体亚基 rrn 26 rrn 18 rrn 5 至少16种 rps 1, rps 3, rps 7, rps 12, rps 13, rps 14, rps 19 rpl 1, rpl 2, rpl 5, rpl 16 rRNA 26S 18S 5S tRNA 核糖体蛋白小亚基 大亚基 翻译装置 亮 苏 亮 亮 亮 亮 CUU、CUC、CUA、CUG 色和精 精 精 精 精 精 CGG 异亮 甲硫 甲硫 甲硫 甲硫 异亮 AUU 异亮 甲硫 异亮 甲硫 甲硫 异亮 AUA 精 精 精 丝 终止 精 AGA、AGG 终止 色 色 色 色 终止 UGA 植物 酵母 粗糙脉孢菌 果蝇 哺
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