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第二章 染色体与DNA 遗传物质的分子结构和性质 基因组和染色体 DNA的复制 DNA损伤与修复 重组和转座 DNA的复制 第一节 半保留复制的验证 半保留模型 (semioconservetive model) 全保留复制模型 (conservetive model) 分散模型 (Dispersive model)。 半保留复制的验证实验 一、Meselson-Stahl实验 (1958) 半保留复制 冈崎实验中的假象 E.coli dUTPase,它能使dUTP变成dUMP,dUMP是不能作为DNA合成的底物,这样它就不再能加入DNA中。 尿嘧啶N-糖苷酶(uracil N-glycosylase),它可以切断混合尿苷的糖苷键,形成无Pu和Py位点(apurinic or apyrimidinic ,AP),再由AP内切酶在AP位点切出一个缺口,进一步进行切除修复。 在dut-突变体(dUTPase缺失)中冈崎片段比在dut+中为短。这是因为U掺入机会增加; 在ung-(尿嘧啶N-糖苷酶缺失)突变体中,新合成的DNA约有一半由片段组成。 因为尿嘧啶N-糖苷酶缺失,不会切除U的糖苷链,也就不会出现AP位点,所以碱沉淀时不易断裂,从而保持了半不连续的原貌。 在dut-, ung-双突变体中,结果和实验(2)相同,更进一步证实了此推测。 二、如何打开超螺旋? 引物 RNA作为引物(primer) RNA引物的大小 原核生物:通常为50~100个核苷酸 真核生物:约为10个核苷酸 RNA引物的顺序 与其模板DNA的碱基顺序相配对 四、复制起始点、复制子、复制方向 DNA在复制时,需在特定的位点起始,这是一些具有特 定核苷酸排列顺序的片段,即复制起始点。 细菌的OriC结构特点: 串联重复序列(tandem repeat): A-T 回文结构(palindrome) E. coli oriC 复制起始区的结构特点是: 富含A-T,这可能和双链易于解开起始复制有关; 含有多个回文结构(9-14个GATC)8个GATC较保守,GATC中的“ A”已甲基化; 具有 4个反向重复顺序,作为蛋白结合位点; 此顺序的右侧毗邻区域有两个起动子,其可能的作用是: ①转录产生引物; ②产生复制必要的蛋白; ③产生调节功能的RNA; ④起转录激活作用。 细菌(或质粒)复制原点的什么特征保证了它在每一循环只起始复制一次呢? 是起始发生了一些改变,且这些改变在复制原点作标记,所以已复制的复制原点与未复制的复制原点能够加以区别吗? 用于这一目的的一些序列包含在复制原点。 OriC 包含11个拷贝的 它是甲基化的靶序列,在腺嘌呤的N6位置被Dam甲基化酶所甲基化。 四、参与DNA复制的物质 3、DNA聚合酶 (DDDP) 以dNTP为前体催化合成DNA 需要模板和引物的存在 不能起始合成新的DNA链 催化dNTP加到生长中的DNA链的3‘-OH末端 催化DNA合成的方向是5→3 DNA聚合酶的校对功能 5→3外切酶活性 (3)、真核细胞的DNA聚合酶 五种 DNA聚合酶α DNA聚合酶δ和PCNA DNA聚合酶γ DNA聚合酶β、ε 参与随从链的合成 参与前导链的合成 参与线粒体DNA的合成 参与DNA的修复 DNA的复制 DNA复制中所需的酶和蛋白 DNA解旋酶是一类解开氢键的酶,由水解ATP来供给能量。它们常常依赖于单链的存在,并能识别复制叉的单链结构 又称为双螺旋去稳定蛋白(helix destabilizing protein)。 当解旋酶将双链打开以后,单链DNA具有一种潜在的恢复原来双链的能力,重新形成氢键。 而且单链本身若有反向重复也会形成发夹结构. 这两种情况都会影响复制,但SSB可以解决这一问题。 DNA拓扑异构酶是可以切断DNA链又能重新连接DNA的一种酶。可分为两类: I型拓扑异构酶 II型拓扑异构酶 DNA聚合酶不能从头合成DNA的一条链,所以需要一个引发反应来提供3`端羟基。 这一反应是由引发酶所提供的。 引发酶具有RNA聚合酶活性,在E.coli中是dna G基因的产物。 是DNA复制的主角。 在E.coli中有三种: DNA Pol I;II;III 起主导作用的是DNA Pol Ⅲ 大部分的DNA聚合酶仅能合成一段较小的片段后即会与模板脱离。 但前导链需要连续复制,这就需要一个机制保证DNA聚合酶能长时间与模板结合,提供这一功能的即为滑动夹钳。 在DNA复制的起始过程中引入的小片段RNA是如何去除的? RNAseH可以特异性的降解与D
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