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第3章与生命过程相关的配位化学金属酶和金属蛋白
(2)含钴辅因子———辅酶B12 钴也是微量的生物必需元素,但是钴的生物无机化学却与其他微量必需元素有许多不同之处。 首先,一般金属酶、金属蛋白活性中心中的微量和超微量元素金属离子与生物配体间的作用主要是依靠金属离子与氮、氧、硫、磷等杂原子间的相互作用,形成M-X配位键(M:金属离子,X:N、O、S、P等配位原子)。而含有钴的辅酶B12中,在金属钴离子周围除了Co—N配位键之外,还含有钴-碳键,即有机金属键。 再者,钴在生物体内的含量虽然不高,但是由于它在体内的分布很集中,主要就存在于辅酶B12中,因此发现较早。 图3.26 钴胺素及咕啉环与卟啉环的结构 图3.27 辅酶B12参与的1,2-重排反应作用机理 配位化学 第3章 与生命过程相关的配位化学 ——金属酶和金属蛋白 3.1 生物体系中的金属离子 3.1.1 金属酶、金属蛋白及金属药物 金属酶就是必须有金属离子参与才有活性的酶,或者简单地说是结合有金属离子的酶,它们在各种重要的生化过程中完成着专一的生化功能,金属酶实际上是一种生物催化剂,它们使得生物体内一系列复杂的化学反应能够在常温常压中性介质条件下顺利地完成。 金属离子与蛋白形成的配合物,其主要作用不是催化某个生化过程,而是完成生物体内诸如电子传递之类特定的生物功能,这类生物活性物质被称之为金属蛋白,所以它们是结合有金属离子的复合蛋白。 金属酶和金属蛋白中金属离子的结合方式有: ⅰ.金属离子与蛋白链中氨基酸残基通过配位作用直接结合; ⅱ.金属离子与硫等其他原子形成簇合物后再结合到蛋白上; ⅲ.金属离子与辅基(例如血红素铁、叶绿素、钴胺素等)结合,然后通过辅基与蛋白连接。 3.1.2 生命元素 生命元素又称必需元素或生物必需元素。 G.C.Cotzias等人认为作为生物必需元素需要具备以下几个条件: ⅰ.元素在不同的动物组织内均有一定的浓度; ⅱ.去除这些元素会使动物造成相同或相似的生理或结构上的不正常; ⅲ.恢复其存在可以消除或预防这些不正常;ⅳ.元素有专门生物化学上的功能。 3.1.3 有毒元素 有毒元素是指那些存在于生物体内会影响正常的代谢和生理功能的元素。 值得注意的是,同一元素往往既是必需元素,又是有毒元素,典型的例子有Cd、Pb、Cr等。 图3.1 生物必需元素摄入量与生物效应之间的关系 3.2 典型金属酶金属蛋白 3.2.1 含铁氧载体 氧载体是生物体内一类含金属离子的生物大分子配合物,可以与分子氧进行可逆地配位结合,其功能是储存或运送氧分子到生物组织内需要氧的地方。 (1)血红蛋白、肌红蛋白 图3.2 血红素a、b、c的结构示意 图3.3 肌红蛋白及其活性中心结构 (2)蚯蚓血红蛋白 天然氧载体中还有一类含铁的非血红素蛋白———蚯蚓血红蛋白。 图3.8 蚯蚓血红蛋白中双铁活性中心的结构及与氧分子的结合方式 3.2.2 含铁蛋白和含铁酶 (1)电子传递蛋白———细胞色素c 电子传递反应可以说是生物体系中最基本的一类反应。 图3.9 马心细胞色素c与血红素铁的结构 (2)含铁金属酶———细胞色素P-450 自然界中许多物质的代谢都涉及与空气中氧分子的反应。其中有一类重要的反应就是氧分子在酶的催化作用下氧化加合到底物分子中去,这一类反应被称之为加氧反应,催化该类反应的酶被称之为加氧酶(oxygenase)。 图3.11 2-茨酮存在下细胞色素P-450cam活性中心的结构 3.2.3 锌酶 图3.12 细胞色素P-450催化反应机理 (1)碳酸酐酶 图3.13 碳酸酐酶及活性中心锌离子周围的结构 (2)羧肽酶 在生物体系中催化水解蛋白链的酶主要分为2种,即催化水解蛋白链C末端氨基酸残基的羧肽酶(carboxypeptidase,简称CP)和断裂蛋白链N末端肽键的氨肽酶(aminopeptidase)。 图3.16 牛胰腺羧肽酶A及活性中心锌离子周围的结构 (3)碱性磷酸酯酶 在生物体系中除了这些单核金属酶之外,还有一些酶在其活性中心中含有两个或两个以上的金属离子。碱性磷酸酯酶(alkalinephosphatase,简称AP)就是其中的一个。 图3.18 碱性磷酸酯酶的X衍射晶体结构及其活性中心的结构 图3.19 碱性磷酸酯酶催化水解磷酸单酯反应的可能机理 3.2.4 铜蛋白和铜酶 含铜的金属蛋白和金属酶也广泛存在于生物体中。一方面铜的含量较高,在微量必需元素中仅次于铁和锌,另一方面铜与铁一样具有可变化合价,因此在生物体中可以参与电子传递、氧化还原等一系列过程。 (1)质体蓝素———Ⅰ型铜 代表性Ⅰ型铜蛋白有质体蓝素(plastocyanin)和阿祖林(azurin)。由于该类蛋白通常呈深蓝色,因此通常也被称为蓝铜蛋白(bluecop-perprotein)。实际上这些只含有Ⅰ型铜的蛋白在生物体系
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