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1绪论氨基酸结构蛋白质结构与功能
1.生物化学的主要研究内容是什么?
答:生物化学根据其研究的对象分普通生化和专业生化。前者讨论一般性的生化问题,即共同的规律;后者指专业特殊的生化问题,根据不同的专业分为动物生化,植物生化,微生物生化,医学生化,农业生化,工业生化,医药生化等。
2.蛋白质合成氨基酸有哪些种,哪些是酸性氨基酸,哪些是碱性氨基酸,哪些是非极性氨基酸?
答:
酸性氨基酸:天冬氨酸(Asp,D)、谷氨酸(Glu,E)、天冬酰胺(Asn,N)、谷氨酰胺(Gln,Q);
碱性氨基酸:赖氨酸(Lys,K)、精氨酸(Arg,R)、组氨酸(His,H)、脯氨酸(Pro,P);
非极性氨基酸:丙氨酸(Ala,A)、缬氨酸(Val,v)、亮氨酸(Lue,L)、异亮氨酸(Ile,I)、苯丙氨酸(Phe,F)、色氨酸(Trp,w)、甲硫氨酸(Met,M)、脯氨酸(Pro.P)。
3.什么是氨基酸的等电点,如何求氨基酸的等电点?
答:(1)在水溶液中,氨基和羧基在不同的pH条件下表现出不同的解离状态,在特定的pH条件下会呈电荷中性,这时的pH称为等电点(isoelectric point),以符号pI 来表示。
(2)等电点的求法:
① 先写出解离方程式;
②找出中性分子状态;
③中性状态分子两边的解离常数的平均值即为pI。
4.茚三酮反应的原理是什么,它的主要应用是什么?
答:茚三酮在弱酸性溶液中与-氨基酸共热,引起氨基酸氧化脱氨、脱羧反应,最后茚三酮与反应产物——氨和还原茚三酮发生作用,生成紫色物质。脯氨酸和羟脯氨酸,与茚三酮反应不释放NH3,而直接生成亮黄色化合物。
用纸层析或柱层析把各种氨基酸分开后,利用茚三酮显色可以定性鉴定并且用分光光度法在570nm定量测定各种氨基酸。定量释放的CO2可以用测压法测量,从而计算出参加反应的氨基酸量。
5.试述分配层析的基本原理。
答:分配层析:利用不同组分在流动相和固定相之间的分配系数不同,使之分离。在支持物上形成部分互溶的两相系统。一般是水相和有机溶剂相。常用支持物是硅胶、纤维素和淀粉等,这些亲水物质能储留相当量的水。被分离物质在两相中都能溶解,但分配比率不同,展层时就会形成以不同速度向前移动的区带。
相应规律:
1.分配定律: Kd=Ca/Cb
2.有效分配系数:Keff=CaXVa/CbXVb=KdXRv
6.分子筛层析的原理,它与其它层析方法有何不同?
答:原理:凝胶是一种多孔性的不带表面电荷的物质,当带有多种成分的样品溶液在凝胶内运动时,由于它们的分子量不同而表现出速度的快慢,在缓冲液洗脱时,分子量大的物质不能进入凝胶孔内,而在凝胶间几乎是垂直的向下运动,而分子量小的物质则进入凝胶孔内进行“绕道”运行,这样就可以按分子量的大小,先后流出凝胶柱,达到分离的目的。
区别:所有的层析在原理上都是相通的,区别在于流动相和层析剂之间的作用力的不同。
(1)离子交换是利用蛋白质表面的电荷与层析剂上的离子基团的静电作用。
(2) 吸附柱层析是以固体吸附剂为固定相,以有机溶剂或缓冲液为流动相构成柱的一种层析方法。
(3)薄层层析是以涂布于玻板或涤纶片等载体上的基质为固定相,以液体为流动相的一种层析方法。这种层析方法是把吸附剂等物质涂布于载体上形成薄层,然后按纸层析操作进行展层。
7.如何描述蛋白质的一级结构?
答:蛋白质的共价结构有时也称一级结构。根据IUPAC的规定蛋白质的一级结构指肽链的氨基酸顺序。
其命名方法:根据参与其组成的氨基酸残基来确定,规定从肽链的NH2末端氨基酸残基开始,称为某氨基酰某氨基酰……某氨基酰。
8.肽键和一般的酰胺键有何区别,肽键结构有何特点?
答:在有机化学中,酰胺键是-CO-NH-,碳氧双键,氮氢单键。在生物化学中,酰胺键就是指肽键,由一分子氨基酸的氨基与另一分子氨基酸的羧基脱水反应而来。即形成肽键至少要2个以上氨基酸,只有多肽里面的酰胺键才叫做肽键。
或者可以说,肽键都是酰胺键,酰胺键包括肽键但不等同于肽键。酰胺键所指的范围比肽键的大。
肽键的性质:是蛋白质分子中的主要共价键,性质比较稳定。它虽是单键,但具有部分双键的性质,难以自由旋转而有一定的刚性,因此形成肽键平面,则包括连接肽键两端的C-O、N-H和2个Ca共6个原子的空间位置处在一个相对接近的平面上,而相邻2个氨基酸的侧链R又形成反式构型,从而形成肽键与肽链复杂的空间结构。
9.氨基酸序列测定有何意义?
答:蛋白质的一级结构是其高级结构的基础,因此,蛋白质序列分析对于获得有关高级结构的信息是一个很有用的基础。 蛋白测序提供的信息可以确定组成蛋白质的氨基酸的种类,确定蛋白质N-末端的氨基酸序列,确定新的蛋白质,通过DNA重组技术构建寡核苷酸探针;根据免疫学机理制备抗多肽的抗体。
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