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核苷酸
核酸 核苷酸 磷酸 核苷 (DNA:脱氧戊糖) 戊糖 碱基 一、核苷酸 核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多,大部分是上述碱基的甲基化产物。 如5-甲基胞嘧啶等 。tRNA中含较多的稀有碱基。 见书P479页 糖与碱基之间的C-N键,称为C-N糖苷键。 糖与碱基之间的C’-N键,称为C-N糖苷键。 假尿苷连接方式:C1’—C5 多磷酸核苷酸 ATP是生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。它的结构如下: 二、核酸的共价结构 核酸是由核苷酸聚成的生物大分子,无分支。 核酸的共价结构即核酸的一级结构,亦即核苷酸的排列顺序。 核苷酸顺序,即碱基顺序。 在多聚核苷酸(DNA或RNA)链中,由于构成核苷酸单元的戊糖和磷酸基是相同的,体现核苷酸差别的实际上只是它所带的碱基,所以多聚核苷酸链结构也可表示为: 注意方向:5’ 3’ mRNA共价结构的特点 1、原核生物:转录产生多顺反子 2、真核生物:转录产生单顺反子 真核mRNA: (1)帽子结构:甲基鸟苷三磷酸(m7G5’ppp5’Np) P485 (2)尾巴结构:3’-聚腺苷酸 真核细胞mRNA的3’-末端有一段长达20-250个核苷酸左右的聚腺苷酸(polyA),称为 “尾结构” ,5’ -末端有一个甲基化的鸟苷酸,称为” 帽结构“ 。 三、DNA的高级结构 (一)DNA碱基组成的Chargaff规则: 1、A=T; 2、C=G 3、A+C=G+T 含氨碱基=含酮碱基 4、A+G=C+T 嘌呤总数=嘧啶总数 (二)DNA的二级结构 1953年,J. Watson和F. Crick提出了著名的DNA双螺旋结构模型,其依据:(1)核酸化学结构和核苷酸键长键角;(2)DNA碱基组成规律;(3)DNA结晶的X-衍射图谱。 1.DNA双螺旋结构的特征 (1)两条反向平行多聚核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕;两条链均为右手双螺旋。 (2)嘌呤和嘧啶位于双螺旋的内侧,磷酸和脱氧核糖位于螺旋外侧。碱基环平面与纵轴垂直,糖基环平面与纵轴平行。两条链配对偏向一侧,形成一条大沟和一条小沟。 (3)双螺旋平均直径约为2 nm,每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34 nm,两核苷酸之间沿纵轴旋转360 ,每10个核苷酸形成一个螺旋,其螺矩(即螺旋旋转一圈)高度为3.4 nm。 (4)两条DNA链相互结合以及形成双螺旋的力是链间的碱基对所形成的氢键。A,T配对,其间形成2个氢键,C,G配对,其间形成3个氢键。 DNA双螺旋的其它形式 1、上述为B型DNA,DNA还可以其它构象存在: 2、A-DNA 3、Z-DNA 自学 4、三股螺旋DNA(H-DNA) (三)DNA的三级结构 DNA在二级结构的基础上可产生三级结构。 DNA三级结构是指DNA分子双螺旋通过进一步扭曲和折叠所形成的特定超螺旋构象。 超螺旋包括正超螺旋和负超螺旋,一般是在环状DNA分子中形成。 细菌质粒DNA的不同状态 松弛型 正螺旋和负螺旋 (四)DNA与蛋白质复合物的结构 重点掌握核小体的结构(自学)。 四、RNA的高级结构 RNA是单链分子,因此,在RNA分子中,并不遵守碱基种类的数量比例关系,即分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。 RNA分子中,部分区域也能自身回折形成双螺旋二级结构,不能形成双螺旋的部分,则形成突环。这种结构可以形象地称为“发夹型”结构。二级结构进而折叠,也可形成三级结构。 (一)tRNA的高级结构 1、tRNA的二级结构 tRNA的二级结构都呈” 三叶草” 形状,在结构上具有某些共同之处,一般可将其分为四臂四环: 四臂:氨基酸臂、反密码臂、二氢尿嘧啶臂、T?C臂 四环:反密码环、二氢尿嘧啶环、T?C环、额外环。 (1)氨基酸臂:7对碱基组成,包含有tRNA的3’-末端和5’-末端, 3’-末端为CCA-OH,接受活化的氨基酸。(2) 二氢尿嘧啶环:由8-12个核苷酸组成,该区含有2个二氢尿嘧啶。(3)反密码环:由7个核苷酸组成,环中部为反密码子,由3个碱基组成。 (4) 额外环:又称可变环) 不同的tRNA该环组成变化较大,作为分类指标。 (5) T?C环: 又称假尿嘧啶核苷—胸腺嘧啶核糖核苷环,几乎所有tRNA在此环中都含有T?C。 2、tRNA的三级结构 在三叶草型二级结构的基础上,突环上未配对的碱基由于整个分子的扭曲而配成对,目前已知的tRNA的三级结构均为倒L型。 (二)rRNA高级结构 * 第13章 核酸的结构 核酸(DNA和RNA)是一种线性多聚核苷酸,它的基本结构单元是核苷酸。 核苷酸本身由核苷和磷酸
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