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运用蛋白质组学技术研究结肠黏膜腺瘤及腺癌组织蛋白的差异表达
运用蛋白质组学技术研究结肠黏膜、腺瘤及腺癌组织蛋白的差异表达
作者:崔冀, 汪建平, 蔡世荣, 彭俊生, 黄奕华, 何裕隆, 骆衍新, 胡坤华 作者单位:中山大学 1. 附属第一医院胃肠胰外科, 2. 附属第六医院胃肠病学研究所//结直肠肛门外科,广东 广州 3. 中山医学院蛋白质组学研究中心, 广东 广州
【摘要】 【目的】 通过比较结肠正常黏膜、腺瘤、腺癌组织之间的蛋白质组表达差异,寻找结肠腺癌相关的蛋白质,筛选结肠癌早期诊断的分子标志物。 【方法】 运用比较蛋白质组学技术,对8例结肠癌患者(伴有腺瘤)的正常黏膜、腺瘤、腺癌组织提取的总蛋白进行双向电泳(2-D),分析凝胶图片选择两两间差异表达超过2倍的蛋白质进行MALDI-TOF/TOF质谱分析和生物学信息分析。 【结果】 成功建立结肠正常粘膜、腺瘤、腺癌的双向凝胶电泳图谱,在凝胶电泳图谱中平均蛋白质斑点数分别为3 066、2 986和3 289,其中两两间表达差异超过2倍的斑点共有31个,质谱分析和数据库检索共鉴定出18种蛋白质,包括keratin 8、 S100A6、 protein disulfide isomerase等。从功能分析,这些差异蛋白与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关。【结论】 比较蛋白质组学能较好地提示结肠腺癌与腺瘤及正常组织间的蛋白质表达差异,而对相关差异表达蛋白的研究有可能为结肠癌的早期诊断和治疗提供新的分子靶向。
【关键词】 腺癌; 腺瘤; 结肠; 蛋白质组学
Identification of Differentially Expressed Proteins in Colonic Mucosa, Adenoma, and Adenocarcinoma by Proteomics
CUI Ji1, WANG Jian-ping2, CAI Shi-rong1, PENG Jun-sheng2, HUANG Yi-hua1, HE Yu-long1,
LUO Yan-xin2, HU Kun-hua3
( 1. Department of Gastrointestinal Surgery, The First Affiliated Hospital; 2. Digestive Surgery;
3. Protemics Research Center, SUN Yat-sen University, Guangzhou 510080, China )
Abstract: 【Objective】 To investigate the cancer associated proteins and sensitive biomakers for early diagnosis of colon adenocarcinoma by using proteomic technique. 【Methods】 Two-dimensional gel electrophoresis was used to define patterns of protein expression in morphologically normal colonic mucosa from 8 subjects with adenocarcinoma and adenomatous polyps. Proteins expressed differently with a 2-fold change among groups which were cut and analyzed by MALDI-TOF/TOF mass spectrometry. 【Results】 Two-dimensional protein maps of colonic mucosa, adenocarcinoma and adenoma were analyzed and gel-analysis software identified an average of 3 066 spots in normal tissue, 2 986 in adenoma tissue while 3 289 in adenocarcinoma and statistical filtering yielded 31 spots of a 2-fold change, 18 of which were identified by using mass spectrometry, including keratin 8, S100A6, protein disulfide isomerase, and so o
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