9生物物理学讲义【DOC精选】.docVIP

《生物物理学》讲义 参考教材：袁观宇主编，生物物理学，科学出版社，2006年4月第1版 第一章 分子生物物理 分子生物物理学是运用物理学理论与技术来研究生物大分子（蛋白质、核酸、多糖和脂质）的结构及其构象变化、分子内部以及大小分子间的相互作用、生物体系中的能量状态等，以便理解生物大分子特定生物学功能的分支学科。 1.1 蛋白质分子的结构和功能 蛋白质功能的多样性：是生命活动的物质基础，是细胞和生物体的重要组成成分（生物膜上的蛋白质、胶原纤维），催化新陈代谢中的绝大部分化学反应（淀粉酶），运动（肌球蛋白、肌动蛋白），运输（血红蛋白、细胞色素c传递电子），调节（胰岛素），调控（阻遏蛋白），接受和传递信息（受体），防御（免疫球蛋白），贮藏（卵清蛋白）等。 1.1.1 蛋白质的化学组成 蛋白质的元素组成：主要含C、H、O、N（平均为16%，这是凯氏定氮法测定蛋白质含量的依据）、S五种；有些蛋白质含P、Fe、Cu、I、Zn、Mo等。 1.1.2 蛋白质的基本结构单位——氨基酸 天然氨基酸有100多种。 用于构成蛋白质的氨基酸只有20种，除脯氨酸外，其余19种氨基酸都是α-氨基酸（即与-COOH相连的α-碳原子上连接有-NH2）。除甘氨酸外，其余19种氨基酸的α-碳原子均为手性碳原子，因此具有旋光性（即使偏振光平面旋转），从构型来看都是L-氨基酸。 氨基酸在不同pH条件下，所带电荷不同。氨基酸可在阴离子、两性离子（兼性离子）和阳离子三种形式之间转变。调节溶液的pH，使氨基酸所带正负电荷数目相等，此时溶液的pH称该氨基酸的等电点（pI）。 在同一pH条件下，不同氨基酸（或者由氨基酸构成的蛋白质）所带电荷要么相同、要么不同，但不同氨基酸（蛋白质）的体积终究有差异，在同一电场中，其泳动速度有不同，这就是电泳的基本原理。 根据R的极性将氨基酸分为非极性氨基酸（Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Phe、Trp、Pro）和极性氨基酸。极性氨基酸又按pH6-7条件下所带电荷分为极性不带电荷氨基酸（Ser、Thr、Cys、Tyr、Gln、Asn）、极性带负电荷氨基酸（Asp、Glu）、以及极性带正电荷氨基酸（His、Lys、Arg）。 1.1.3 蛋白质的性质 分子量：10000-1000000 Da以上。 其水溶液具有胶体溶液的性质（布朗运动、丁道尔现象、不能透过半透膜）。 易受理化因素的影响而变性。 在不同pH条件下，所带电荷不同。可在阴离子、两性离子（兼性离子）和阳离子三种形式之间转变。 种类繁多，形态各异，根据形状可分为球状蛋白（血红蛋白）和纤维状蛋白（纤维蛋白）。根据组成可分为简单蛋白（球蛋白）和结合蛋白（糖蛋白）。 1.1.4 蛋白质的空间构象 肽键（-CO-NH-），肽链，氨基酸残基。 蛋白质由一条或一条以上肽链构成。 蛋白质的一级结构主要指氨基酸的连接顺序和二硫键的连接部位。 蛋白质的空间构象包括二级结构、超二级结构、结构域和三级结构，有些还包括四级结构。 蛋白质的二级结构是肽链沿一定方向折叠而成的规律性结构，有α-螺旋、β-折叠、β-转角等。 α-螺旋：绝大多数为右手螺旋，每圈螺旋含3.6个氨基酸残基，螺距为0.54 nm，它的链内氢键在一个残基的亚氨基H和N端第4个残基的羰基O之间形成。 β-折叠：主链锯齿形，在肽链间或肽段间形成氢键。分平行式和反平行式两种类型。 β-转角：它的链内氢键在一个残基的亚氨基H和N端第3个残基的羰基O之间形成。 超二级结构是指在肽链内邻近的二级结构通过折叠而靠近，组合而成的规则的二级结构聚集体，如αα、βαβ、Rossman折叠、β发夹、β曲折、希腊钥匙拓扑结构等。 结构域是指在肽链内邻近的超二级结构紧密联系在一起构成的结构和功能相对独立的单位。 蛋白质的三级结构是指一条肽链折叠形成的总三维结构。 蛋白质的四级结构是指多亚基蛋白质内各亚基之间的空间关系。 1.1.5 蛋白质结构与功能的关系 一级结构相似，空间构象和功能基本相同（胰岛素）。 也有一级结构差别很大，但空间构象基本相同，功能基本相同（血红蛋白）。 空间构象的改变导致功能发生相应的改变（蛋白质的变性、别构蛋白质-血红蛋白）。 1.2 核酸分子的结构及其空间构象 1.2.1 核酸的基本化学组成 组成核酸的元素有C、H、O、N、P（9-10%，可测定P含量来测定核酸的量）等。基本单位是核苷酸。核苷酸由核苷和磷酸构成。核苷由戊糖和碱基构成。 1.2.2 核酸的基本结构单元——核苷酸 由于戊糖有脱氧核糖和核糖之分，构成的核苷分为脱氧核糖核苷和核糖核苷，构成的核苷酸分为脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸，构成的核酸分为脱氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）。 碱基分为嘌呤碱（G、A