基于多核并行排序-IntelSoftware.pptVIP

基于多核并行排序 华南理工大学 陈虎 博士 tommychen74@ 单核排序关注的核心问题 a. 减少要排序数据之间的比较次数。 比如：插入排序 insertsort O(n2) 希尔排序 shellsort O(n3/4) 快速排序 quicksort 平均O(nlogn) 归并排序 mergesort 固定O(nlogn) b. 算法所需要的内存空间。 比如： 插入排序 in place,不用新的空间 希尔排序 和插入排序一样 快速排序 stack, 递归所需堆栈空间 归并排序 一个新的数组来存储排好的数据 多核排序关注的核心问题 a. 每个核以线程为执行单元，排序程序 通过生成相互协作的线程来完成排序。 b. 关注数据集的合理划分。 c. 识别可并行执行的任务。 理论上，基于相同的串行算法和相同的cache命中率， 多核计算速度可以无限接近单核计算速度的P倍，其 中P为核的数目。 多核上的并行排序算法 思想 a.将要处理的数据集均等的分到每个线程中，线程对数据 集各自排序。 b.线程开始根据相同的数划分数据集。 这个数是依据一定的方法选出来的（详见并行算法描述）。每个线程的数据 集都会被分成K份，（其中P= K P2 ，P为核的数目），每份将被称为一桶。 很显然这个过程选出了K个数，这些数将被称为bound_value, 记为 X1, X2, X3…… XK c.最后每个线程中小于或等于X1的数会被一个独立的 线程去归并排序，同样小于或等于X2的数也会被另外 一个独立的线程去归并排序，依次类推，直到排好 序。 多核上的并行排序算法 步骤:1 1、将原始待排序的数据分成P等份，每个处理器上对N0个 数据进行排序，称每个被排序后的子集为B0,…,Bp-1 2、Remain_data=N，设定第0组归并起始位置全部为0, i=0，设置第0组在目标数组中的起始位置为0 3、循环直至remian_dataL 3.1 选取所有子集中起始位置后续L个元素的最小值 bound_value，并获得bound_value的桶号bucket 3.2 在所有子集中从起始位置到后续L个元素中选取边界 位置，使得边界位置的最后一个元素小于或等 bound_value，而边界位置后的第一元素大于 bound_value。 多核上的并行排序算法 步骤:2 3.3 记录所有的边界位置，并设置所有第i＋1组的 起始位置为第i组的起始位置加上边界位置 3.4 累积所有边界值，得到该归并组的大小 3.5 根据归并组大小和本组起始位置计算第i+1组 在目标数组中的起始位置。 4、设置最后一个归并组的边界为N0 5、对所有归并组进行并行P路归并排序。 多核上的并行排序算法 描述 例子： 线程对各自持有的数据排序： 根据算法将选出21将行划分； 然后是66； 最后所剩下的数将作为一组进行归并。 并行算法正确性证明 1 . 任何一个原始待排序数据出现且仅出现在 一个归并组中。 2 . 归并组i中的一个任意元素必然小于等于归并组i+1中的任意元素。 3 . 任意一个归并组的大小介于L和LP之间。 理论加速比和实验结果 * * 本课程得到 Intel?大学合作计划支持 课程网站： /uploadfile/Multicore/index.htm 2 5 11 11 21 52 73 78 8 18 26 33 37 66 77 9