生物化学知识要点(上)要点.docx

生物化学知识要点（上）第二章：氨基酸 1. 氨基酸的区别在于侧链r基的不同。二十种常见氨基酸分类：按照r基的化学结构，20种氨基酸可分为脂肪族，芳香族和杂环族3类。脂肪族氨基酸含5种中性氨基酸（甘氨酸，丙氨酸，缬氨酸，亮氨酸，异亮氨酸）;含羟基或硫元素的氨基酸4种（丝氨酸，苏氨酸，半胱氨酸，甲硫氨酸）；酸性氨基酸及其酰胺4种（天冬氨酸，天冬酰胺，谷氨酸，谷氨酰胺）；碱性氨基酸2种（赖氨酸，精氨酸）杂环氨基酸2种（组氨酸，脯氨酸）；芳香族氨基酸3种（苯丙氨酸，酪氨酸，色氨酸） 组氨酸也是一种碱性氨基酸按r基的极性大小（指在细胞ph即ph=7左右的解离状态下）： 非极性氨基酸: Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Phe, Trp, Met R基具极性不带电荷的氨基酸: Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn, GlnR基带正电荷的氨基酸: Lys, Arg, His R基带负电荷的氨基酸: Asp, Glu2.氨基酸的等电点（概念及计算式，性质）概念：当溶液浓度为某一pH值时，氨基酸分子中所含的正负电荷正好相等，净电荷为0。这一pH值即为氨基酸的等电点，简称pI。在等电点时，氨基酸既不向正极也不向负极移动，即氨基酸处于两性离子状态 计算式：侧链不含离解基团的中性氨基酸，其等电点是它的pK’1和pK’2的算术平均值： pI= (pK1 + pK’2 )/2 侧链含有可解离基团的氨基酸，其pI值也决定于等电兼性离子两边的pK值的算术平均值。 酸性氨基酸：pI= (pK’1 + pK’R-COO-)/2 硷性氨基酸：pI= (pK’2 + pK’R-NH2 )/2 无论氨基酸侧链是否解离，其pI值均决定于净电荷为零的等电兼性离子两边的pK’值算术平均值性质：当低于等电点的任一ph时，氨基酸带有净正电荷，向负极移动；当高于等电点的任一ph时，氨基酸带有净负电荷，向正极移动。在一定的ph范围内氨基酸溶液的ph离等电点越远，氨基酸所带净电荷越多。3..氨基酸的光谱性质（后面的蛋白质同样具有）?芳香族氨基酸（酪氨酸，色氨酸，苯丙氨酸）在280nm波长附近有最大的紫外吸收峰，由于大多数蛋白质含有这些氨基酸残基，氨基酸残基数与蛋白质含量成正比，故通过对波长的紫外吸光度的测量可对蛋白质溶液进行定量分析（核酸在260nm处有最大的吸收峰）第三章：蛋白质的通性，纯化和表征1.蛋白质的性质：胶体性质（具有丁达尔效应）；沉淀（特殊的：盐析）2.蛋白质的等电点同氨基酸，与它所含的酸性氨基酸和碱性氨基酸的数目比例有关。处于等电点处时，蛋白质的溶解度最小。3.蛋白质的等离子点：当没有溶液中的离子干扰时，蛋白质分子本身的质子供体集团解离出来的质子数与它的质子受体基因结合的质子数相等时溶液ph.第四章:蛋白质的共价结构（一级结构）（一起说明蛋白质的高级结构）1.蛋白质的一级结构：即蛋白质分子中氨基酸的排列顺序。主要化学键：肽键，有些蛋白质还包含二硫键。２、蛋白质的高级结构：包括二级、三级、四级结构3.蛋白质的二级结构：指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，也就是该段肽链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象。二级结构以一级结构为基础，多为短距离效应。可分为α螺旋：多肽链主链围绕中心轴呈有规律地螺旋式上升，顺时钟走向，即右手螺旋，每隔3.6个氨基酸残基上升一圈，螺距为0.540nm。α螺旋的每个肽键的ＮＨ和第四个肽键的羧基氧形成氢键，氢键的方向与螺旋长轴基本平形．β-折叠：多肽链充分伸展，各肽键平面折叠成锯齿状结构，侧链Ｒ基团交错位于锯齿状结构上下方；它们之间靠链间肽键羧基上的氧和亚氨基上的氢形成氢键维系构象稳定. β-转角：常发生于肽链进行180度回折时的转角上，常有４个氨基酸残基组成，第二个残基常为脯氨酸。 注：无规卷曲：无确定规律性的那段肽链。主要化学键：氢键 4.蛋白质的三级结构：蛋白质的三级结构：指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，显示为长距离效应。　　主要化学键：疏水键（最主要）、盐键、二硫键、氢键、范德华力。5.蛋白质的四级结构：对蛋白质分子的二、三级结构而言，只涉及一条多肽链卷曲而成的蛋白质。在体内有许多蛋白质分子含有二条或多条肽链，每一条多肽链都有其完整的三级结构，称为蛋白质的亚基，亚基与亚基之间呈特定的三维空间排布，并以非共价键相连接。这种蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，为四级结构。由一条肽链形成的蛋白质没有四级结构。　主要化学键：疏水键、氢键、离子键重要：多肽链的部分裂解(p49)蛋白酶是一类肽链内切酶称为内肽酶。在蛋白质测序中常用到的有：胰蛋白酶：最常用到的，专一性强，只断裂碱性氨基酸（赖氨酸残基或者是精氨酸残基的羧基参与形成的肽键