生物信息学应用.ppt

* * * * * * * * * * * * 参考书：钟扬（小黄本） * * 数据分析 基因表达数据库（GEO、SMD、CGED、ArrayExpress等） GEO是NCBI网站中的一个基因表达数据库 GEO包括五种主要的记录 平台记录GPL*** 样品记录GSM*** 系列记录GSE*** 数据集记录GDS*** 表达谱Profile 基因表达数据库（gene expression omnibus, GEO） 平台、样本、数据集、表达谱和基因 实例：查看并分析胃癌相关基因表达数据集 GDS1210页面 下载文件 Vinmentin在各样本中的表达谱 聚类分析图 研究分支 2001_2010年结直肠癌易感基因的生物信息学分析 85种转化基因的过敏原性生物信息学评价 代谢性心血管病变_生物信息学的应用 帕金森病路易（小）体的蛋白质生物信息学数据分析 蛋白质相互作用网络进化分析研究进展 可变剪接与疾病的生物信息学研究概况 DNA甲基化的生物信息学研究进展 新型长链非编码RNA_lncRNA_的生物信息学研究进展 生物信息技术加速开发旧药新用途 基于生物信息学方法发现潜在药物靶标 生物信息学技术在食物过敏原表位预测中的应用 生物信息学在免疫学上的应用 供常规临床应用的数据库 dbMHC 是有关主要组织相容性复合体(MHC)的数据库。它收录了各种MHC等位基因的变异信