华中农业大学化学生物学资料.doc

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华中农业大学化学生物学资料

糖生物学,一门以寡糖或糖缀化合物为研究对象,以糖化学、免疫学及分子生物学为手段,研究寡糖连作为“生物信息分子”在多细胞、高层次生命中的功能的学科。 与蛋白质相比较,寡糖的结构和功能研究更加复杂,因为在很多糖蛋白中蛋白质和寡糖部分的生物功能彼此不相干,因此需要将寡糖与相关的蛋白质分离再进行研究,特定的寡糖功能只有在特定的寡糖缀合物中才能表现,烫的结构不是由基因组DNA直接决定,是通过基因编码的糖基转移酶控制,糖基转移酶对糖具专一性,即一种酶对应着一种糖苷链连接。 意义:糖生物学研究的是糖作为信息分子和调节分子在生物体的各项生命活动以及病理机制中的作用,糖类分子是继核酸和蛋白质之后的构成生物信息的又一大类重要生物分子,很多疾病与细胞表面糖结构的改变密切相关,糖生物学的研究有利于疾病的诊断和治疗,炎症过程有糖类的糖蛋白参与,糖生物学和分子生物学、细胞生物学、病理学等生物科学领域相关,糖作为生物体内传导识别和调控信息的分子,其研究将大放光彩。 单糖是不能水解的糖,为含有3-7个碳原子的多羟基醛、酮类化合物,是构成各种糖分子的基本单元,天然存在的单糖一般为D-型,结构可以是环状或链状,生物体内常见的单糖有葡萄糖果糖甘露糖岩藻糖半乳糖等,单糖衍生物包括组成DNA的脱氧核糖和RNA的核糖。葡萄糖为D-型还原性糖,能被斐林试剂土伦试剂或溴水溶液氧化为D-葡萄糖酸,或通过催化氢化生成D-葡萄糖醇,同时葡萄糖能与苯肼作用生成D-葡萄糖脎,葡萄糖结构中的羟基能够发声酯化和醚化反应,在环状葡萄糖中C1连接四个不同的原子,具有手性,被称为异头碳,C1存在α-和β-两种构型,溶液中葡萄糖两种构型平衡存在,是发生变旋光现象的原因。 二糖:一个环状单糖半缩醛(半缩酮)的羟基与另一个分子(醇、嘌呤、嘧啶、糖)的羟基,胺基或巯基之间缩合形成糖苷键。寡糖:一般2~10个糖苷键聚合形成的化合物为寡糖,参与信号转导等生物过程的糖为寡糖。结构十分复杂,主要体现在连接方式多种多样,其构像是动态的。糖的缀合物与糖基化:1、N-连接糖基化:(1)、脂连接前体寡糖的形成(2)、寡糖整体转移到多肽(粗面内质网)(3)寡糖的加工和再加工(高尔基体)糖型:共同的多肽但携带不同的聚糖的糖蛋白分子。(glycoform)连接核心的糖基化只有一种寡糖转移酶2、O-连接糖基化:具有特殊功能,高尔基体丝氨酸,苏氨酸是O-连接聚糖的潜在结合位点。所有的糖是从与苏/丝氨酸结合的第一个N-乙酰半乳糖胺开始,按顺序逐个加上去的。不存在预先形成的核心或整体转移。3、以羧基为连接点,进行糖基磷酯酰肌醇化,形成糖基磷酸酰基醇锚定蛋白。4、糖基与糖苷配基以C-C链直接相连,形成C-糖基化。5、Phosphoglycosylation,仅在寄生虫、黏菌中发现。糖脂:糖和脂质结合所形成的物质的总称。在生物体分布甚广,但含量较少,仅占脂质总量的一小部分。糖脂亦分为两大类:糖基酰甘油和糖鞘脂。糖鞘脂又分为中性糖鞘脂和酸性糖鞘脂。细胞表面的糖脂在神经系统发育中有重要作用。 寡糖的合成:糖的保护基:用于在合成过程中保护功能基团的物质在合成过程中,一些功能基团要被保护。保护基原则:1保护基便宜,易得,稳定,无毒引入条件合适2在反应过程中是稳定的3其脱出条件温和且高效4分子脱保护基后,保护基部分与产物容易分离。有些保护基会影响其他功能基团的活性,包括电子效应,位阻效应等。选择保护基应当同时存在多种保护基,脱出一种不对其他的产生影响。(一般的,羟基经常需要保护,其保护基一般有酯类保护基,醚类保护基,缩醛及缩酮类保护基) 寡糖的液相合成:线性合成:采用逐步接长法,按位置和构型的要求将单糖用糖糖苷键连起来,合成指定结构的寡糖,一般用于相对分子质量较小的寡糖,否则总体步骤多,工作量大,风险高。收敛式合成法:采用预先合成的小寡糖片段以收敛的方式组装完成目标寡糖的合成。优点:1小的寡糖片段可以是天然的二塘衍生物,可直接用于合成2昂贵单糖片段可在收敛合成的后期引入降低成本3操作步骤少,风险低。用于相对分子质量较大寡糖合成。双向式合成:以目标寡糖中一个中心单糖为出发点,利用此单糖既可以作为受体也可以作为供体向两侧延长糖链,最终完成目标寡糖的合成。兼备上两种方法的优点。“一锅法”合成:在合成中通常不分离,在一个反应器中完成所有反应,避免了保护基操作和中间体的分离与纯化,合成效率高。分三类:利用糖基供体的活性差别实现糖基化的连续性,利用糖基受体活性的差别实现糖基化的连续性,综合通过糖基供体和受体的不同活性实现糖基的连续性。 寡糖的固相合成:非常复杂,还需进一步完善1.固相载体的选择:分为不溶性载体和可溶性载体。可溶性载体优点:不需加入过量反应试剂,所有化学变化都在均相中进行,分析检测方面有优势;缺点:沉淀过程中产物损失较大。以聚乙二醇为基础的可

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