第七章数量遗传学基础略讲.pptVIP

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第七章数量遗传学基础略讲

第七章 数量遗传学基础 第一节 数量性状的遗传特征 一、数量性状的多基因假说 多基因假说(multiple factor hypothesis) 性状区分的不同方法 典型数量性状分布图(正态分布) 二、数量性状表型值的剖分 表型值(P)是由基因型值(G)和环境值(E)共同作用的结果,即P=G+E 在一般情况下,个体环境效应有正负之分,在样本含量足够大的群体中,总和为零,即∑E=0 基因型值存在3种不同的效应,即基因加性效应(A)、等位基因间的显性效应(D)和非等位基因间上位效应(I),即G=A+D+I 由于D和I带有一定的随机性,一般均将它们与环境偏差合并,统称为剩余值(R),即R=D+I+E 因而公式简化为:P=A+R 第二节 通径分析 一、通径系数的概念 二、通径系数的定理(略) 定理二(间接原因) 定理三(共同原因) 定理四 三、通径链的追溯规则(略) 第三节 重复力 一、概念 二、重复力的估计方法(略) 例题:小梅山母猪产仔数记录 总方差、组间方差、组内方差 小梅山母猪产仔数方差分析表 三、重复力的主要用途 第四节 遗传力 遗传力的几种表述(略) 二、遗传力估计的原理和方法(略) (一)遗传力估计的原理 (二) 公畜内女母回归或相关法 (三) 半同胞相关 (四) 全同胞相关法 三、遗传力的显著性检验 四、畜禽部分性状的遗传力(略) 五、提高遗传力估计精确度的方法 第五节 遗传相关(略) 一、性状间的相关及其剖分 二、遗传相关估计方法 1、亲子协方差法 2、同胞协方差法 三、遗传相关的显著性检验 第六节 线性模型与非线性模型 二、模型分析 三、常用非线性模型 当各组半同胞数量不同时: 以同父子女分组,经方差分析计算所得的组内相关系数: 在实际应用中可以省略估计方差组分的步骤,用均方直接计算半同胞相关: 理论上相等,实际上不相等。 当这三个估计值相差太大时,应该补充资料,重新估计 1、当采用公畜内女母回归 2、当采用半同胞相关 3、当采用全同胞相关 1、遗传力是数量遗传学中的重要参数。 2、具体用途: 预测遗传进展 估计个体育种值 指定综合选择指数 此外,在家畜选育过程中,根据遗传力的大小,针对要改进的性状确定其繁育方法、选择方法及建系方法。 1、女母回归法: 2、半同胞相关法: n=最宜家经含量,S=公畜数,dfS=最小公畜自由度 例如,表7-6 表型相关:表型值间的相关 环境相关:家畜在发育过程中受共同环境影响而产生的相关 遗传相关:性状育种值间的相关 基因的多效 基因座位之间的连锁 选择造成的基因座位之间的连锁不平衡 表7-7给出了一些性状间表型相关、遗传相关和环境相关。 同胞间的平均协方差等于组间方差(COVxx, COVyy) 同胞间的平均交叉协方差等于组间协方差(C-COVxy) Reeve(1955)提出了由亲子关系估计遗传相关时的取样误差公式: 由于取样误差公式比较复杂的,Robertson(1959)提出了一个近似公式: (一) 线性模型 一、基本概念 (二) 非线性模型 * * 质量性状:一类性状可明确区分为若干种相对形状,并可用形容词进行描述。如毛色、角的有无等。 数量性状:一类性状的变异是连续的,无法用形容词描述,只能通过度量测定,并用数量来表示。如产奶量、生长速度、体重、羊毛的粗细等。 数量性状是许多对基因共同作用的结果 每一对基因对性状表型的表现所产生的效应是微效的 微效基因的效应是相等,而且相互累加 微效基因显性不完全 微效基因对环境敏感 最早由Yule(1906)提出,然后由Nilsson-Ehle and Johannsen完善 质量性状 红:白=63:1 数量性状 红颜色的深度 例:假定仔猪初生重由2对等位基因(A1a1, A2a2)控制,不同位点基因具有相同的加性效应,其中A为200g,a为100g,等位基因A对a完全显性,位点2对位点1有上位效应,当位点2为杂合状态时可增加位点1基因型10%的加性效应。 0 0 400 400 a1a1a2a2 20 100 500 620 a1a1A2a2 0 0 600 600 a1a1A2A2 0 100 500 600 A1a1a2a2 30 200 600 830 A1a1A2a2 0 100 700 800 A1a1A2A2 0 0 600 600 A1A1a2a2 40 100 700 840 A1A1A2a2 0 0 800 800 A1A1A2A2 I D A G 基因型 Path Analysis Wright(1921)提出来 猪的屠宰体重(Y),由生长速度(X1)和4月龄体重(X2)决定,而它们又是由饲养条件(X3)决定。 右图省略 X3 1、两个变量间的关系: 因果关系: 单箭头线,方向由因到果,称为通径线

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