DNA甲基化芯片服务.docVIP

Illumina?DNA甲基化芯片服务 ? 服务名称：Illumina Infinium HumanMethylation27 BeadChip服务?芯片内容：采用Infinium技术方案，每张芯片可检测12个样本。每个样本可检测27,000个CpG位点。覆盖约13,000个有明确注释的基因（NCBI CCDS Database1，Genome Build 36），超过1000个肿瘤相关基因，200个miRNA基因启动子，150个已知的甲基化状态具有组织特异性的DNA区段。 服务推荐：Illumina 450K Infinium Methylation BeadChip服务?芯片内容：该芯片设计了450,000多个甲基化位点，全面覆盖了96%的CpG岛，并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、正常组织与肿瘤（多种癌症）组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、miRNA启动子区域和已通过GWAS的疾病相关区域的位点，同时覆盖了HumanMethylation27 BeadChip的90%的位点。每张芯片可平行进行12个样本的检测。集合了全面、高样品通量，以及价格实惠等优点。 ? ? Infinium甲基化芯片实验原理 ? 服务推荐：Illumina GoldenGate Methylation Cancer Panel I 服务芯片内容：采用GoldenGate技术方案，包含了807个肿瘤相关基因的1,505 CpG 岛。71.4％的基因拥有2个或2个以上的CpG位点。? ? 特别推荐：Illuumina甲基化芯片应用文献精选 ? ? Nimblegen DNA甲基化芯片服务 ? 服务推荐1：Nimblegen全基因组DNA甲基化芯片服务 芯片推荐：Nimblegen 2.1M Whole-Genome Sets?芯片介绍：该芯片均一的覆盖全基因组的非重复序列，高密度的探针使得仅需少量的芯片就可以高分辨率的对复杂的基因组进行分析。目前全基因组有两种格式：探针间隔为100bp的10×芯片和探针间隔为200-255bp的较为经济的4×芯片。目前只有针对人、小鼠、大鼠和拟南芥的产品，其中人和小鼠的芯片含有新的阳性、阴性以及非CpG对照区域，实现更好的质控。?芯片推荐：Nimblegen 385K Whole-Genome Sets?芯片介绍：该款芯片探针以约100bp的间隔均一的覆盖基因组非重复区。目前可应用的物种有人、小鼠、大鼠、狗、鸡、拟南芥、线虫和果蝇。 ? 服务推荐2：Nimblegen启动子DNA甲基化芯片服务 芯片推荐：Nimblegen 2.1M Deluxe Promoter Arrays芯片介绍：该款芯片包含人、小鼠约10kb的启动子区域，同时也覆盖了所有注释过的CpG岛、miRNA启动子以及人工选择的ENCODE（仅限人）区，探针间隔约为100bp。该芯片同时也含有新的阳性、阴性以及非CpG对照区域，实现更好的质控。芯片推荐：Nimblegen 385K?Two-Array?Promoter?Sets?芯片介绍：该款芯片包含了所有注释过的剪接变体和选择选择性转录起始位点。该芯片为研究由RefSeq、MGC和UCSC所包含的转录调控元件在基因组水平的图谱提供了最为全面的工具。目前只有针对人、小鼠、大鼠和拟南芥的产品。?芯片推荐：Nimblegen 385K?RefSeq?Promoter?Arrays?芯片介绍：包含RefSeq数据库中所有被较好特征化的基因，长为50-75mer的探针以约100bp的间隔覆盖启动子区域。目前只有人、小鼠和 大鼠相关产品。?芯片推荐：Nimblegen 385K?RefSeq?XM?Promoter?Arrays?芯片介绍：包含了由NCBI基因组注释计划所产生的accession号以XM开头的序列，它们代表了又ab initio的预测结果，或者和已知基因具有一定的同源性。这些序列代表了在NCBI?Contigs中注释的转录本和蛋白，它们可能与GenBank中提交的mRNAs或curated?RefSeq中以NM、NR、NP开头的记录有所不同。目前只有针对人和小鼠的产品。?芯片推荐：Nimblegen 385K?Minimal?Promoter?Arrays?芯片介绍：该款芯片探针以约100bp的间隔均一的覆盖基因组非重复区。目前可应用的物种有人、小鼠、大鼠、狗、鸡、拟南芥、线虫和果蝇。 服务推荐3：Nimblegen Taged Designs 甲基化芯片服务 芯片推荐：Nimblegen 385K?CpG?Island Plus Promoter Arrays芯片介绍：包含了UCSC中所有注释过