01-博士生课——生命科学前沿进展——转录-魏炽炬课稿.ppt

Chapter 9 RNA聚合酶的作用是将双链体DNA的一条链拷贝成RNA链. 一个转录单位被转录为一条RNA链. 9.3 The transcription reaction has three stages. ?转录的三个阶段. RNA聚合酶结合DNA启动子序列后, 转录启动. 在延伸过程中, 转录泡沿着DNA移动, RNA链从5′向3′方向增长. 在终止子转录终止, DNA双链重新聚合, RNA聚合酶从DNA链上解离下来. 转录有4个阶段, 各阶段RNA聚合酶和DNA发生不同的作用. 酶先结合到启动子上, 然后破坏DNA结构, 在转录起始时酶保持固定, 延伸时沿着DNA移动, 并在终止处解离. 9.4 Phage T7 RNA polymerase is a useful model system. ?T7噬菌体的RNA聚合酶---一个好的模型系统. T3和T7噬菌体的RNA聚合酶由一条肽链构成, 具有最低限度的聚合酶活性, 仅能识别少数噬菌体的启动子序列. 9.7 RNA polymerase consists of the core enzyme and sigma factor. ?RNA聚合酶包括核心酶和?因子. 细菌RNA聚合酶可以分成具有催化转录活性的?2 ? ??核心酶以及仅在起始转录时所需的?亚基 ?因子改变了RNA聚合酶结合DNA的性质, 使得它对一般的DNA亲和力降低, 而对启动子的亲和力增加 根据每一个启动子上的转录起始频率计算, RNA聚合酶对不同启动子的亲和常数, 可有6个数量级上的差别. 9.12 Promoter recognition depends on consensus sequences. ?启动子的识别依赖于一些共有序列. 启动子是一些特定位点的短保守序列. 启动子的保守序列包括起始点处的一个嘌呤, -10区的六聚体TATAAT以及-35区的另一个六聚体. 不同启动子之间通常在共有序列的一个或多个位置上存在差别. 典型的启动子包括三个元件, -35区, -10区和起始点的保守序列. 9.16 ?Substitution of sigma factors may control initiation. ??因子的替换可以控制启动. 大肠杆菌有多个?因子, 每一个都能使RNA聚合酶启动-35区到-10区的特殊启动子序列. ?70是启动转录的通用因子, 其他因子只有在特定条件下才能被激活. 除了?70, 大肠杆菌还有其他受特殊环境诱导的?因子. RseA作为内膜蛋白被合成. 它的细胞质结构域结合?E因子. RseA蛋白依次在外周间质和细胞质中被切割, 而细胞质中的切割释放了?E. 在大肠杆菌中, 不同的?因子识别具有不同共有序列的启动子. 9.20 Bacterial RNA polymerase terminates at discrete sites. ?细菌RNA聚合酶的终止发生在不连续的位点. 终止可能既需要DNA上可识别的终止序列, 也需要RNA产物的发夹结构. 终止需要的DNA序列位于终止子序列之前. RNA发夹结构的形成也可能是必须的. 9.21 There are two types of terminators in E. coli. ?大肠杆菌的两种终止子. 内源性终止子包括RNA产物中一个G-C含量较高的发夹结构以及在它之后的富含U的区域. 这一区域也是终止反应发生的位置. 内源性终止子包括一个回文序列, 形成长度在7-20bp之间的发夹结构. 这些茎环结构包括一个G-C富集区, 随后是一些U残基. 9.22 How does rho factor work?. ? ?因子如何工作? ?因子是一个终止蛋白, 它结合到新生RNA上, 再转位到位于真正的终止位点之前的富含C缺少G残基的序列上. ?因子沿着RNA链追赶RNA聚合酶, 当它在?-依赖的终止子上追到聚合酶时, 终止发生. 9.23 Antitermination is a regulatory event. 抗终止是一个受调控的过程. 当抗终止蛋白作用于RNA聚合酶, 使其越过特殊的一个或多个终止子实现通读时, 终止被阻抑. ?噬菌体有两种抗终止蛋白pN和pQ, 它们作用于不同的转录单位. 抗终止蛋白可以作用在RNA聚合酶上, 使之越过特定终止子而通读. * Transcription 转录 9.1 Introduction引言 The coding strand (Sense strand) of DNA has the same sequence as the mRNA and is related by the genetic code to the protei