原创力文档- 1、本文档共18页，可阅读全部内容。
- 2、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
查看更多
Zakery 2016年5月26日 如何在phytozome中找物种同源基因并用DNAman比对序列 首先到phytozome网站上选择你要找的物种，比如水稻Oryza sativa v7_JGI (Rice) 点击BLAST search 在target type中选择proteome，把氨基酸序列复制到BLAST框中，点GO 这是结果，得分越高说明同源性越高 点击第一个前面字母G，得到如图可以看到CDS sequence和Peptide equence 把基因名和CDS序列如图复制到记事本，把txt格式改为SEQ格式（直接更改扩展名） 接下来就是用DNAman分析了 选择输入序列 选择序列文件所在位置 注意输入的序列是DNA或者是蛋白质序列,打勾相应的选项 然后一直点击下一步 选项不需要修改,默认就行 选项不需要修改,默认就行 选项不需要修改,默认就行 注意,由于是用了免费的版本,它会在这里加上了一段标记,手工去除它. 序列前面一般会加上CREATED..FEATURESLCATINQUALIFIERS这一段标记 这是去除后的序列情况 点击这个按钮,出现下拉菜单 保持EMF格式的文件即可,然后用图片查看器打开可以放大缩小而不改变像素 前面软件演示所用的序列比对后做出来的图 注意:由于前面软件自动加了约为几十个bp长度的标记,因此在所获得的图中,会在尾部出现N多个点,不影响图片的质量与美观!
文档评论（0）