分子遗传学课件-遗传多态性解读.ppt

基因组多态性 基因组多态性：在不同群体或个体之间，基因组的某些位点上碱基的差异。这种差异也称之为分子遗传标记。 遗传标记是指可以明确反映遗传多态性的生物特征 在经典遗传学中,遗传多态性是指等位基因的变异. 在现代遗传学中,遗传多态性是指基因组中任何座位上的相对差异. DNA分子标记是DNA水平上遗传多态性的直接反映.DNA水平的遗传多态性表现为核苷酸序列的任何差异,哪怕是单个核苷酸的变异.因此,DNA标记在数量上几乎是无限的. DNA遗传标记特点： 1.直接反映基因特征，非推测。 2.基因座位数量多，无论表达与否。 3.多态性程度高，等位基因多，鉴别能力强。 4.适合于陈旧的样品，检测能力强。 5.灵敏度高，有利于微量样品的检测。 6.易于检测手段的自动化、标准化，重复性好。逐渐取代了蛋白质水平的检测方法。 DNA多态性的分类 1）长度多态性：等位基因片段长度的个体差 别。由一特定序列，首尾相连串联 重复次数不同产生的个体差别。 可变数目串联重复（variable number of tandem repeat,VNTR） 短串联重复(short tandem repeat,STR) A：产生原因：DNA滑动与同源染色体 不等交换。 2）序列多态性：DNA片段碱基排列顺序的个体差别。 单核苷酸多态性 （single ucleotidepolymorphism,SNPs） 原因：碱基的置换、插入、缺失。 特点：多位于非编码区，选择压力。 数量多，1/1000 bp，300万 二态性，2个等位基因，多态性 程度较低。 孤立事件，人类遗传学意义大。 DNA标记的分类 依据多态性的检测手段,DNA标记可分为四大类: (1)基于DNA-DNA杂交的DNA标记. 该标记技术是利用限制性内切酶及凝胶电泳分离不同生物体的DNA分子,然后用经标记的DNA探针,通过放射自显影或非同位素显色技术来揭示DNA的多态性.其中最具代表性的是发现最早和应用广泛的RFLP标记. (2)基于PCR的DNA标记. 根据PCR所用的引物特点,这类DNA标记可分为随机引物PCR标记和特异引物PCR标记.随机引物PCR标记包括RAPD标记和ISSR等,随机引物PCR所扩增的DNA区段事先未知,具有随意性和任意性,因此随机引物PCR标记技术可用于对任何未知基因组的研究.特异引物PCR标记包括SSR标记和STS标记等,特异引物PCR所扩增的DNA区段事先是已知的明确的,具有特异性.因此特异引物PCR标记技术依赖于对各个物种基因组信息的了解. (3)基于PCR和限制性酶切技术结合的DNA标记.这类DNA标记可分为二种类型,一种是通过对限制性酶切片段的选择性扩增来显示限制性片段长度的多态性,如AFLP标记.另一种是通过对PCR扩增的片段的限制性酶 切来揭示被扩增的区段的多态性,如CASP标记. 4)基于单核苷酸多态性的DNA标记,如SNP标记.单核苷酸多态性（SNP）标记被称为第三代分子标记 。它也是以以PCR技术为基础的分子标记技术。 基于遗传标记的发展历程 第一代标记 经典的遗传标记（蛋白质和免疫学的标记） 70年代中后期，限制酶片段长度多态性（RFLP） 第二代标记 85年，“小卫星序列（minisatellite） 89年，“微卫星序列（microsatellite） 第三代标记 单核苷酸多态性标记（single nucleotide polymorphism ，SNP） 遗传标记中的第一代标记 经典的遗传标记（蛋白质和免疫学的标记） ABO血型位点标记 HLA位点标记（人类白细胞抗原） 存在问题： 已知多态的蛋白质很少 等位基因的数目有限 无法获得足够的信息量 检测技术的繁琐等 —限制了人类基因组的遗传分析工作 —促使人们直接在DNA上寻找遗传标记 蛋白质和免疫学的标记 同工酶的多态性 遗传标记中的第一代标记 RFLP( restriction fragment length polymorphism) 标记技术 RFLP即限制性片段长度多态性.是指用某一种限制性内切酶来切割来自不同个体的DNA分子上，内切酶的识别序列有差异，即是由限制性酶切位点上碱基的插入、缺失、重排或点突变所引起的。这种差异反映在酶切片