南大西洋深海表层沉积物细菌多样性和生物地理学研究解读.ppt

南大西洋深海表层沉积物细菌多样性和生物地理学研究 研究背景 微生物群落的生物地理格局有两个传统的解释，即环境异质性和历史因素。 环境条件长期以来被认为对微生物地理学有强大的影响力。几项研究已经表明空间距离（历史因素）会影响微生物的多样性。 在海洋生境比如深海，表层沉积物中的微生物可以随着洋流而扩散。由较大的底栖生物的活动以及近底洋流共同影响沉积物 - 水界面交换的生物灌溉作用导致了颗粒的分散因此微生物得以扩散。 影响微生物扩散的障碍可能是物理的（地形）或其他条件（温度，pH值或静水压力） 深海微生物地理模型依赖于微生物的扩散能力。一个可能的限制微生物扩散的因素是鲸脊。 我们调查了南大西洋东部三大盆地中的细菌群落来研究深海表层沉积物中细菌群落的多样性和生物地理学。 在南大西洋东部，海角盆地与安哥拉和几内亚盆地之间通过鲸脊形成一个屏障阻挡了水下大约3000米处向北和向南的水流。 海角盆地是受来自南极的绕极深层水控制，安哥拉和几内亚盆地的最深处都充满了从北极起源来的北大西洋深层水。 值得注意的是，鲸脊已被证明用于一些囊虾总目的甲壳类扩散的屏障，但不知道该物理屏障是否也影响微生物的传播。 材料与方法 16S rRNA基因克隆文库的构建： 表层沉积物取样（0-2cm) 用 FastDNA SPIN Kit for Soil提取总DNA PCR扩增(引