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Section EDNA Replication E1: DNA Replication:An Overview 1. Replicons(复制子) 2.semi-conservative mechanism 3.semi-discontinous replication 4.RNA priming(引导) E1-1 Replicons 复制子:以单一单位复制的任一段DNA。 复制从特定的位点-起始点开始,两个复制叉双向进行至终点。 原核生物染色体:程环形 单一复制子 一个起始点(复杂) 密度标记实验 半保留机制:在复制中,DNA双螺旋的两条亲代链分开,分别作为模板指导酶催化的新生互补子链的合成。 这样每个子细胞接受亲代DNA双链中的一条。 DNA合成的底物:脱氧核苷三磷酸(dNTP) 反应机制:新生链3’端核苷酸的3’-OH与下一个碱基互补的a-磷原子处的亲核攻击。 E1-3 Replication isSemi-discontinuous E1-4 RNA priming The first few nucleotides at the 5’-end of Okazaki fragments are ribonucleotides. Hence, DNA synthesis is primed by RNA that is then removed before fragments are joined. Crucial for high fidelity of replication E2: BacterialDNA replication 1. Experimental system 2. initiation, 3. unwinding, 4. elongation, 5. termination segregation E2-1: In vitroexperimental systems Re-initiation of bacterial replication at new origins before completion of the first round of replication E2-3: Unwinding Positive supercoiling: 复制叉处螺旋转角的去除会导致分子其余部位额外转角的导入 . type II topoisomerase (DNA旋转酶) E2-4: Elongation(延伸) 引发体:包含DnaB解旋酶和DNA引物酶 DNA聚合酶III全酶:二聚体(Mg2+,dNTP, 5’-3’ , 3’-OH末端引物链,模版链) 单体 a亚基-聚合酶作用 ?亚基-外切核酸酶:3’-5’校正作用 ?亚基-将聚合酶结合到DNA上 其它亚基-不同,合成长或短的DNA DNA聚合酶I:切除引物,填补DNA 5’-3’ 聚合酶 5’-3’ 外切酶 3’-5’ 校正外切核酸酶酶 DNA连接酶:催化磷酸二酯鍵 E2-5: Termination andSegregation(终止与分离) ?Tus protein: ter binding protein, an inhibitor of the DnaB helicase E4: EukaryoticDNA replication 1. Experimental system 2. initiation, 3. replication forks, 5. telomere replication. E3-3: Replication fork elongation 其它DNA复制方式 DNA复制 E4 真核生物DNA复制:起始 实验系统 DNA:酵母(14000 kb / 400复制子)、SV40 cell-free system:非洲爪蟾 复制起始 早:常染色质,中:异染色质,晚:着丝点和端粒 自动复制序列(ARS); 起始点识别复合体(ORC) Replication fork E4 真核生物DNA复制:延伸和终止 相关酶和蛋白质 解旋酶 单链结合蛋白(RP-A,replication protein A) 延伸酶-
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