基于曙光2000的MPI运行验证.pdfVIP

1 基于曙光-2000 的 MPI 运行验证 崔焕庆 韩丛英 山东科技大学信息科学与工程学院 泰安 271019 smart0193@，congyh@ 摘 要 本文对共享消息传递接口库 MPI(Message Passing Interface)在曙光-2000 并行计算机上进行了 验证，就点到点通信方式、模式的区别用 Petri 网模型进行了描述；并对某些 MPI 函数在应用中发现 的问题提出了一些解决方案，使用户能更好得利用 MPI 编写并行程序。 关键词 MPI ；曙光-2000 ；点到点通信；Petri 网 一、 引言 MPI （Message Passing Interface ）是一个免费共享的消息传递并行库，作为一个标准，它的主要目 标是开发一个应用广泛、可移植性好的消息传递程序。MPI 强大的并行性已经在许多类并行机得到验 证，特别是在分布式存储的并行机上 MPI 这种消息传递并行模型更能充分发挥其通信能力。 MPI 主要包括以下几个方面的内容：点到点通信 （一对进程之间的通信）；集群通信 （一个进程组 内所有进程的通信以及同步操作）；组、上下文、通信子；进程拓扑；环境管理等等。在这些内容中最 常用的是 MPI 的通信函数，详细研究通信函数的四种通信模式是非常有意义的。因为 MPI 不是根据哪 一类特殊的并行机设计的，所以对于曙光-2000 这样分布式存储的并行计算机来说，MPI 的许多常用函 数有其不同于在其它并行机上的应用特点，所以研究验证 MPI 函数在曙光-2000 上的应用非常有实用 意义，更便于用户充分利用 MPI 顺利编写及调试并行程序。 二、 点到点通信方式的 Petri 网描述 在 MPI 中，点到点通信是最基本最常用的通信，因此熟悉掌握它的通信方式以便有效使用之。 点到点通信分为两种方式——阻塞方式与非阻塞方式，这两种通信方式从表面上看，它们的区别 在于：阻塞方式的通信用一个函数来实现发送操作或者接收操作的启动与完成，而在非阻塞通信方式 中，却用两个函数——启动函数和完成函数——来实现发送操作或者接收操作。从本质来讲，它们的 区别在于：阻塞方式的一个操作的启动与完成之间不允许做其他的事情，即使操作的完成要等待较长 的时间；而非阻塞方式的一个操作的启动与完成之间可以进行一些计算等，以实现资源的充分利用。 下面用 petri 网（图 1）来区别这两种方式： s 1 t 1 s2 t2 s3 t3 s4 ? ? s5 t4 s6 (a) 阻塞通信的 petri 网模型 s2 t2 s3 t3 s4 1 ? 国家自然科学基金19871052 ）资助项目，山东省自然科学基金（Q98A08116）资助项目 ? s 1 t 1 s7 t5 s6 s5 t4 (b)非阻塞通信的 pet