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基于计算地球动力学的大规模并行计算环境与应用.pdf
基于计算地球动力学的大规模并行计算环境与应用
张怀石耀霖曹建玲朱桂芝
中国科学院研究生院计算地球动力学实验室北京100049
海量数据处理和大规模数值模拟已经成为当代计算地球动力学研究的主要手段和主要特色之一。近些年
来,应用于地球系统科学中的观测和试验手段和能力大大加强和提高。如GPS和GIS系统的出现,各种现代化
数字式海洋和高空大气传感器的使用,使得广大从事地球动力学研究的科研工作者们每天都要面对海量的地球
科学的数据。尤其是各种科学和资源探测卫星的使用,让人们已经能够从更高,更广,更精确的角度去观察,
数据的出现,让我们的传统的地球动力学的研究,正在走出简单的理论模型与猜测,走向对实际问题的真实数
值模拟的时代。计算地球动力学, 正在成为地球科学研究领域中一个最活跃和开放的分支学科,进入了它旺盛
的发展时代。
大规模和超大规模并行计算迫切需要快速发展的大规模甚至是超大规模的科学与工程计算的软硬件资源
的发展与之相适应。因为对地球动力学过程的数值模拟需要大规模的高性能数值计算能力。应该说,这个发展
方向已经或者正在成为国际上计算地球科学领域的专家学者们的一个共识。但是,谁都不能够忽略这样一个发
展瓶颈,那就是现在在这个方面的软件平台的发展严重滞后于硬件技术的发展,更滞后于地球动力学研究的实
际需要
Simulator是目前运行速度最快
为了解决这个问题,各个国家都提出了自己的对策和手段。L=I本的Earth
的超级并行计算机,它的70%的工作负载用于地球系统科学研究的数值模拟工作。为配合这个超级计算机的应
固体地球物理的多目的、多场耦合有限元数值模拟软件平台。这个软件平台采用开放源代码的方式,软件平台
涉及的内容包括并行大规模非结构化网格剖分子系统,并行可视化系统,计算固体力学,计算流体力学等多方
面系统的结合。项目开展至今已经取得了很好的研究成果。部分研究成果代表了世界上比较领先的水平。美国
科学家的主要方式是建立专门由于计算地球动力学的通用计算中心,也就是建立固体地球过程模拟(地球和行
施和人员配备包括高性能计算中心的硬件设施和技术支持,以及高水平的数值计算专家、从事现代软件设计、
程序编写和友好图形界面制作等方面的专业高级人才。中心设立学术委员会,学术委员会指导下的科学家和软
件工程师的虚拟研究所,但也要包含一个真实的中心,安置核心软件队伍和硬件支持。
在解决这个问题上,中国科学院研究生院计算地球动力学实验室有着自己独特的发展思路。近几年来,实
验室发展一个以并行有限元程序自动生成系统为基础的面向全体计算地球动力学科研人员的大规模并行计算平
台环境。这个环境主要包括:
I)建立一个小型的计算地球动力学小型数据高性能计算和网格计算的实验环境,硬件环境包括一台16节
点PC.Cluster和正在安装的16节点高性能PC.Cluster。
2)软件环境主要是在这个环境上安装远程并行有限元程序自动生成系统,提供给国内的计算地球动力学
领域以及其它地球科学领域的科研工作者远程使用。
现互联,在给美国和中国科学家提供远程并行有限元源程序生成服务的同时,也让本实验室和中国的地球动力
学家免费获取美国最新的地球科学观测和试验数据;同时加入PRAGMA和iSERVO国际合作项F1。
实验室的研究人员进两年已经在这个平台的基础上,取得了一些研究成果,如美国西部活动构造数值模拟、
福州地区地震波数值模拟、基于全新模型的印度洋海啸大规模数值模拟等。
这个平台的使用和完善,将最大限度的节省国内广大地球动力学领域的专家学者的有限元计算程序开发时
间,将科研精力集中到他们熟悉和擅长的实际科学模型当中去,丽把自己不熟悉,不擅长的并行计算和网格计
算交给本系统来完成,这将使他们如虎添翼,提高科研效率,多出成果,出高水平的成果。
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