近交和近交系数.ppt

生物技术教研室 第八章 数量性状的遗传 补充：近交和近交系数 近交 近交（inbreeding）指的是具有共同祖先的个体彼此交配，这对后代的基因型分布具有影响。 若不考虑连锁的作用，为了考察近交效应，只需讨论一个位点的情况就够了。 近交 血统相同 ： 有亲属关系的亲本可能携带其共同祖先同一等位基因的复制品，从而就有把该等位基因传递给后代的特定概率。在这种情况下，后代就会具有两个相同的等位基因，亦即该共同祖先同一等位基因的复制品，那么，这两个等位基因就是血统相同的（identical by descent）。比如，这样产生的后代具有基因型BB，那么，这两个等位基因B就属于血统相同的。 近交 状态相似 ： 群体中可能还有另外一类具有BB基因型的个体，其中的两个等位基因B不是血统相同的，而仅是状态相似的（alike in state）。 近交 群体内个体所具有的可能的祖先数。取决于向回追溯的世代数。每向回追溯一代，祖先数就增加一倍。向回追溯10代，每个个体就有210 = 1024个祖先，向回追溯20代，则有大约106个祖先。由此可见，每个个体必然具有彼此有亲属关系的祖先。在这种情况下，只有定义一个基础群体，其中的任何一个个体都不具有血统相同的等位基因，而且，所有纯合基因型的等位基因都可以认为是状态相似的。这时，上述的一些定义才有意义。 近交系数 近交的作用可通过近交系数（inbreeding coefficient）F加以衡量。 近交系数F是个体一个位点上的两个等位基因属于血统相同的概率（Malecot，1948）。 近交系数的大小取决于交配体系。在动物中亲属个体间可进行交配；大多数植物都能进行自花授粉，这是近交的最有力形式。 近交系数 还有一种与近交系数密切相关的度量值，这就是两个个体在一个位点上携带血统相同等位基因的概率。Malecot（1948）把这个概率叫做“亲缘系数”（coefficient de parente）；Kempthorne（1957）称其为“血统系数”（coefficient of parentage）；Falconer（1981）则采用术语“共祖度”（coancestry）表示这个意思。下面通过例子说明两者之间的关系。 近交系数 假定个体X具有等位基因x1和x2，个体Y具有等位基因y1和y2，现计算概率P(xi = yj) ，其中xi可能是x1或x2，yj则可能是y1或y2，从而得到： 上式中?xy是共祖系数（coefficient of coancestry）。 近交系数 近交系数F与共祖系数?之间的关系如下： 近交系数 一般情况下，计算个体近交系数的方法有两种，第一种方法应用系谱中的径路系数（path coefficient）；另一种方法则是应用共祖系数，通过t ? 1代的共祖系数说明t代个体的近交系数。下面通过例子说明这两种方法。 系谱中的径路系数 假如要计算亲本A和B的后代个体Z的近交系数，这时必须考虑由A到A与B的共同祖先再到B的这一过程中的所有径路。图1提供一个假定系谱，其中I是A和B的一个共同祖先，与其有关的一条径路是ACEIGDB，这条径路对个体Z近交系数的贡献是： 系谱中的径路系数 假如要计算亲本A和B的后代个体Z的近交系数，这时必须考虑由A到A与B的共同祖先再到B的这一过程中的所有径路。 系谱中的径路系数 图1提供一个假定系谱，其中I是A和B的一个共同祖先，与其有关的一条径路是ACEIGDB，这条径路对个体Z近交系数的贡献是： 其中n是该径路中的基因型数。 系谱中的径路系数 图1 系谱图 系谱中的径路系数 假定I是非近交的，那么，I传递同一等位基因给E和G的概率都是1/2，E再将来自I的基因传递给C的概率也是1/2，依此类推。 个体Z的近交系数则是所有径路的贡献之和。 系谱中的径路系数 由图上看出共有3条可能的径路，即：ACEIGDB，ACEIHB和ACEIKHB。 因此，Z的近交系数为： 系谱中的径路系数 如果共同祖先本身是近交的，那么，有关径路对近交系数的贡献增加。 系谱中的径路系数 再来考察径路ACEOGDB。 令个体I的近交系数是FI，个体I传递相同等位基因给E和G的概率仍各为1/2。如果I传递给E和G的等位基因不同（这个概率也是1/2），那么，这两个不同的基因属于血统相同的概率则是FI，因而，I传递给E和G的等位基因属于血统相同的总概率则是 系谱中的径路系数 该条径路的贡献则是： 系谱中的径路系数 同理可得，径路ACEIHB的贡献是： 径路ACEIKHB的贡献是： 系谱中的径路系数 在这种情况下，Z的近交系数为：